Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPL2

Clstn1, Calsyntenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn1Q9EPL2 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Clstn1Q9EPL2 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Clstn1Q9EPL2 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Clstn1Q9EPL2 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Clstn1Q9EPL2 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Clstn1Q9EPL2 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Clstn1Q9EPL2 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Clstn1Q9EPL2 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Clstn1Q9EPL2 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Clstn1Q9EPL2 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Clstn1Q9EPL2 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Clstn1Q9EPL2 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Clstn1Q9EPL2 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Clstn1Q9EPL2 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Clstn1Q9EPL2 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Clstn1Q9EPL2 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Clstn1Q9EPL2 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Clstn1Q9EPL2 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Clstn1Q9EPL2 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Clstn1Q9EPL2 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Clstn1Q9EPL2 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Clstn1Q9EPL2 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Clstn1Q9EPL2 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Clstn1Q9EPL2 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Clstn1Q9EPL2 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Clstn1Q9EPL2 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Clstn1Q9EPL2 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Clstn1Q9EPL2 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Clstn1Q9EPL2 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Clstn1Q9EPL2 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Clstn1Q9EPL2 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Clstn1Q9EPL2 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Clstn1Q9EPL2 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Clstn1Q9EPL2 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Clstn1Q9EPL2 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Clstn1Q9EPL2 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Clstn1Q9EPL2 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Clstn1Q9EPL2 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Clstn1Q9EPL2 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Clstn1Q9EPL2 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Clstn1Q9EPL2 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Clstn1Q9EPL2 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Clstn1Q9EPL2 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Clstn1Q9EPL2 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Clstn1Q9EPL2 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Clstn1Q9EPL2 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Clstn1Q9EPL2 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Clstn1Q9EPL2 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Clstn1Q9EPL2 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Clstn1Q9EPL2 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Clstn1Q9EPL2 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Clstn1Q9EPL2 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Clstn1Q9EPL2 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Clstn1Q9EPL2 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Clstn1Q9EPL2 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Clstn1Q9EPL2 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Clstn1Q9EPL2 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Clstn1Q9EPL2 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Clstn1Q9EPL2 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Clstn1Q9EPL2 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Clstn1Q9EPL2 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Clstn1Q9EPL2 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Clstn1Q9EPL2 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Clstn1Q9EPL2 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Clstn1Q9EPL2 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Clstn1Q9EPL2 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Clstn1Q9EPL2 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Clstn1Q9EPL2 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Clstn1Q9EPL2 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Clstn1Q9EPL2 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Clstn1Q9EPL2 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Clstn1Q9EPL2 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Clstn1Q9EPL2 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Clstn1Q9EPL2 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Clstn1Q9EPL2 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Clstn1Q9EPL2 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Clstn1Q9EPL2 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Clstn1Q9EPL2 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Clstn1Q9EPL2 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Clstn1Q9EPL2 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Clstn1Q9EPL2 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Clstn1Q9EPL2 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Clstn1Q9EPL2 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Clstn1Q9EPL2 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Clstn1Q9EPL2 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Clstn1Q9EPL2 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Clstn1Q9EPL2 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Clstn1Q9EPL2 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Clstn1Q9EPL2 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Clstn1Q9EPL2 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Clstn1Q9EPL2 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Clstn1Q9EPL2 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Clstn1Q9EPL2 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Clstn1Q9EPL2 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Clstn1Q9EPL2 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Clstn1Q9EPL2 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Clstn1Q9EPL2 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Clstn1Q9EPL2 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Clstn1Q9EPL2 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Clstn1Q9EPL2 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms