Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCH2

Pop7, Ribonuclease P protein subunit p20, mousemouse

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Length 140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pop7Q9DCH2 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pop7Q9DCH2 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pop7Q9DCH2 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pop7Q9DCH2 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Pop7Q9DCH2 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pop7Q9DCH2 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pop7Q9DCH2 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pop7Q9DCH2 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pop7Q9DCH2 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pop7Q9DCH2 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pop7Q9DCH2 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pop7Q9DCH2 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pop7Q9DCH2 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pop7Q9DCH2 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pop7Q9DCH2 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pop7Q9DCH2 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pop7Q9DCH2 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pop7Q9DCH2 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pop7Q9DCH2 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pop7Q9DCH2 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pop7Q9DCH2 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pop7Q9DCH2 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pop7Q9DCH2 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pop7Q9DCH2 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pop7Q9DCH2 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pop7Q9DCH2 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Pop7Q9DCH2 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pop7Q9DCH2 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pop7Q9DCH2 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pop7Q9DCH2 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pop7Q9DCH2 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pop7Q9DCH2 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Pop7Q9DCH2 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pop7Q9DCH2 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pop7Q9DCH2 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pop7Q9DCH2 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pop7Q9DCH2 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Pop7Q9DCH2 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pop7Q9DCH2 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pop7Q9DCH2 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Pop7Q9DCH2 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pop7Q9DCH2 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pop7Q9DCH2 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pop7Q9DCH2 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pop7Q9DCH2 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pop7Q9DCH2 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pop7Q9DCH2 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pop7Q9DCH2 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pop7Q9DCH2 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pop7Q9DCH2 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pop7Q9DCH2 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pop7Q9DCH2 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pop7Q9DCH2 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pop7Q9DCH2 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pop7Q9DCH2 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pop7Q9DCH2 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pop7Q9DCH2 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pop7Q9DCH2 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pop7Q9DCH2 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pop7Q9DCH2 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pop7Q9DCH2 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Pop7Q9DCH2 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pop7Q9DCH2 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pop7Q9DCH2 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pop7Q9DCH2 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pop7Q9DCH2 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pop7Q9DCH2 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pop7Q9DCH2 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pop7Q9DCH2 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pop7Q9DCH2 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pop7Q9DCH2 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pop7Q9DCH2 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pop7Q9DCH2 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pop7Q9DCH2 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pop7Q9DCH2 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pop7Q9DCH2 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pop7Q9DCH2 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pop7Q9DCH2 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pop7Q9DCH2 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pop7Q9DCH2 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pop7Q9DCH2 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pop7Q9DCH2 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pop7Q9DCH2 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pop7Q9DCH2 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pop7Q9DCH2 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Pop7Q9DCH2 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pop7Q9DCH2 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pop7Q9DCH2 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pop7Q9DCH2 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pop7Q9DCH2 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pop7Q9DCH2 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms