Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU0

Tm9sf1, Transmembrane 9 superfamily member 1, mousemouse

Predictions only

Length 606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm9sf1Q9DBU0 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tm9sf1Q9DBU0 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tm9sf1Q9DBU0 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tm9sf1Q9DBU0 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tm9sf1Q9DBU0 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tm9sf1Q9DBU0 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tm9sf1Q9DBU0 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tm9sf1Q9DBU0 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tm9sf1Q9DBU0 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tm9sf1Q9DBU0 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tm9sf1Q9DBU0 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tm9sf1Q9DBU0 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tm9sf1Q9DBU0 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tm9sf1Q9DBU0 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Tm9sf1Q9DBU0 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Tm9sf1Q9DBU0 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tm9sf1Q9DBU0 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tm9sf1Q9DBU0 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tm9sf1Q9DBU0 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tm9sf1Q9DBU0 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tm9sf1Q9DBU0 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tm9sf1Q9DBU0 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tm9sf1Q9DBU0 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tm9sf1Q9DBU0 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tm9sf1Q9DBU0 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tm9sf1Q9DBU0 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Tm9sf1Q9DBU0 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Tm9sf1Q9DBU0 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Tm9sf1Q9DBU0 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tm9sf1Q9DBU0 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tm9sf1Q9DBU0 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tm9sf1Q9DBU0 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tm9sf1Q9DBU0 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tm9sf1Q9DBU0 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tm9sf1Q9DBU0 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tm9sf1Q9DBU0 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tm9sf1Q9DBU0 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Tm9sf1Q9DBU0 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tm9sf1Q9DBU0 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tm9sf1Q9DBU0 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tm9sf1Q9DBU0 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tm9sf1Q9DBU0 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tm9sf1Q9DBU0 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tm9sf1Q9DBU0 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tm9sf1Q9DBU0 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tm9sf1Q9DBU0 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tm9sf1Q9DBU0 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tm9sf1Q9DBU0 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tm9sf1Q9DBU0 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tm9sf1Q9DBU0 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tm9sf1Q9DBU0 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tm9sf1Q9DBU0 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tm9sf1Q9DBU0 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tm9sf1Q9DBU0 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tm9sf1Q9DBU0 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tm9sf1Q9DBU0 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tm9sf1Q9DBU0 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tm9sf1Q9DBU0 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tm9sf1Q9DBU0 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tm9sf1Q9DBU0 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tm9sf1Q9DBU0 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tm9sf1Q9DBU0 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tm9sf1Q9DBU0 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tm9sf1Q9DBU0 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tm9sf1Q9DBU0 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tm9sf1Q9DBU0 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tm9sf1Q9DBU0 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tm9sf1Q9DBU0 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tm9sf1Q9DBU0 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tm9sf1Q9DBU0 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tm9sf1Q9DBU0 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tm9sf1Q9DBU0 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tm9sf1Q9DBU0 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tm9sf1Q9DBU0 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tm9sf1Q9DBU0 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tm9sf1Q9DBU0 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tm9sf1Q9DBU0 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tm9sf1Q9DBU0 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tm9sf1Q9DBU0 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tm9sf1Q9DBU0 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tm9sf1Q9DBU0 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tm9sf1Q9DBU0 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tm9sf1Q9DBU0 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tm9sf1Q9DBU0 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Tm9sf1Q9DBU0 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tm9sf1Q9DBU0 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tm9sf1Q9DBU0 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tm9sf1Q9DBU0 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tm9sf1Q9DBU0 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tm9sf1Q9DBU0 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tm9sf1Q9DBU0 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tm9sf1Q9DBU0 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tm9sf1Q9DBU0 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tm9sf1Q9DBU0 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tm9sf1Q9DBU0 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tm9sf1Q9DBU0 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tm9sf1Q9DBU0 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tm9sf1Q9DBU0 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tm9sf1Q9DBU0 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tm9sf1Q9DBU0 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms