Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBT3

Ccdc97, Coiled-coil domain-containing protein 97, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc97Q9DBT3 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc97Q9DBT3 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc97Q9DBT3 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc97Q9DBT3 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc97Q9DBT3 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc97Q9DBT3 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc97Q9DBT3 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc97Q9DBT3 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc97Q9DBT3 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc97Q9DBT3 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc97Q9DBT3 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc97Q9DBT3 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc97Q9DBT3 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc97Q9DBT3 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc97Q9DBT3 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc97Q9DBT3 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc97Q9DBT3 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc97Q9DBT3 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc97Q9DBT3 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc97Q9DBT3 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc97Q9DBT3 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc97Q9DBT3 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc97Q9DBT3 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc97Q9DBT3 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc97Q9DBT3 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc97Q9DBT3 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc97Q9DBT3 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc97Q9DBT3 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc97Q9DBT3 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc97Q9DBT3 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc97Q9DBT3 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc97Q9DBT3 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc97Q9DBT3 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc97Q9DBT3 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc97Q9DBT3 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc97Q9DBT3 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc97Q9DBT3 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc97Q9DBT3 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc97Q9DBT3 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc97Q9DBT3 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc97Q9DBT3 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc97Q9DBT3 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc97Q9DBT3 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc97Q9DBT3 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc97Q9DBT3 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc97Q9DBT3 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc97Q9DBT3 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc97Q9DBT3 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc97Q9DBT3 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc97Q9DBT3 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc97Q9DBT3 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc97Q9DBT3 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc97Q9DBT3 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc97Q9DBT3 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc97Q9DBT3 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc97Q9DBT3 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc97Q9DBT3 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc97Q9DBT3 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc97Q9DBT3 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc97Q9DBT3 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc97Q9DBT3 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc97Q9DBT3 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc97Q9DBT3 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc97Q9DBT3 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc97Q9DBT3 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc97Q9DBT3 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc97Q9DBT3 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc97Q9DBT3 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc97Q9DBT3 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc97Q9DBT3 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc97Q9DBT3 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc97Q9DBT3 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc97Q9DBT3 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc97Q9DBT3 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc97Q9DBT3 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc97Q9DBT3 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc97Q9DBT3 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc97Q9DBT3 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc97Q9DBT3 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc97Q9DBT3 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc97Q9DBT3 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc97Q9DBT3 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc97Q9DBT3 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc97Q9DBT3 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc97Q9DBT3 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc97Q9DBT3 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc97Q9DBT3 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc97Q9DBT3 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc97Q9DBT3 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc97Q9DBT3 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc97Q9DBT3 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc97Q9DBT3 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc97Q9DBT3 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc97Q9DBT3 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc97Q9DBT3 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc97Q9DBT3 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc97Q9DBT3 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc97Q9DBT3 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc97Q9DBT3 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc97Q9DBT3 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.9 ms