Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBC7

Prkar1a, cAMP-dependent protein kinase type I-alpha regulatory subunit, mousemouse

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Length 381 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkar1aQ9DBC7 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prkar1aQ9DBC7 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prkar1aQ9DBC7 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prkar1aQ9DBC7 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prkar1aQ9DBC7 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Prkar1aQ9DBC7 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prkar1aQ9DBC7 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prkar1aQ9DBC7 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prkar1aQ9DBC7 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prkar1aQ9DBC7 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prkar1aQ9DBC7 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prkar1aQ9DBC7 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prkar1aQ9DBC7 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prkar1aQ9DBC7 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prkar1aQ9DBC7 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prkar1aQ9DBC7 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prkar1aQ9DBC7 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Prkar1aQ9DBC7 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prkar1aQ9DBC7 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prkar1aQ9DBC7 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prkar1aQ9DBC7 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prkar1aQ9DBC7 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prkar1aQ9DBC7 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prkar1aQ9DBC7 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prkar1aQ9DBC7 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prkar1aQ9DBC7 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prkar1aQ9DBC7 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prkar1aQ9DBC7 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prkar1aQ9DBC7 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Prkar1aQ9DBC7 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prkar1aQ9DBC7 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prkar1aQ9DBC7 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prkar1aQ9DBC7 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prkar1aQ9DBC7 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prkar1aQ9DBC7 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prkar1aQ9DBC7 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prkar1aQ9DBC7 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Prkar1aQ9DBC7 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prkar1aQ9DBC7 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prkar1aQ9DBC7 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prkar1aQ9DBC7 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prkar1aQ9DBC7 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prkar1aQ9DBC7 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prkar1aQ9DBC7 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prkar1aQ9DBC7 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prkar1aQ9DBC7 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prkar1aQ9DBC7 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prkar1aQ9DBC7 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prkar1aQ9DBC7 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prkar1aQ9DBC7 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prkar1aQ9DBC7 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prkar1aQ9DBC7 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prkar1aQ9DBC7 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prkar1aQ9DBC7 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prkar1aQ9DBC7 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prkar1aQ9DBC7 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prkar1aQ9DBC7 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prkar1aQ9DBC7 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prkar1aQ9DBC7 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prkar1aQ9DBC7 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prkar1aQ9DBC7 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prkar1aQ9DBC7 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prkar1aQ9DBC7 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prkar1aQ9DBC7 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prkar1aQ9DBC7 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prkar1aQ9DBC7 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prkar1aQ9DBC7 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prkar1aQ9DBC7 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prkar1aQ9DBC7 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prkar1aQ9DBC7 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prkar1aQ9DBC7 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prkar1aQ9DBC7 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prkar1aQ9DBC7 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prkar1aQ9DBC7 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prkar1aQ9DBC7 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prkar1aQ9DBC7 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prkar1aQ9DBC7 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prkar1aQ9DBC7 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prkar1aQ9DBC7 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prkar1aQ9DBC7 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prkar1aQ9DBC7 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prkar1aQ9DBC7 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prkar1aQ9DBC7 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prkar1aQ9DBC7 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prkar1aQ9DBC7 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prkar1aQ9DBC7 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prkar1aQ9DBC7 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prkar1aQ9DBC7 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prkar1aQ9DBC7 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Prkar1aQ9DBC7 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prkar1aQ9DBC7 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prkar1aQ9DBC7 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prkar1aQ9DBC7 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prkar1aQ9DBC7 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prkar1aQ9DBC7 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prkar1aQ9DBC7 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prkar1aQ9DBC7 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prkar1aQ9DBC7 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prkar1aQ9DBC7 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prkar1aQ9DBC7 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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