Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBC3

Cmtr1, Cap-specific mRNA (nucleoside-2'-O-)-methyltransferase 1, mousemouse

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtr1Q9DBC3 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cmtr1Q9DBC3 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cmtr1Q9DBC3 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cmtr1Q9DBC3 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cmtr1Q9DBC3 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cmtr1Q9DBC3 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cmtr1Q9DBC3 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cmtr1Q9DBC3 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cmtr1Q9DBC3 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cmtr1Q9DBC3 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cmtr1Q9DBC3 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cmtr1Q9DBC3 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cmtr1Q9DBC3 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cmtr1Q9DBC3 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cmtr1Q9DBC3 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cmtr1Q9DBC3 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cmtr1Q9DBC3 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cmtr1Q9DBC3 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cmtr1Q9DBC3 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cmtr1Q9DBC3 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cmtr1Q9DBC3 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cmtr1Q9DBC3 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cmtr1Q9DBC3 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cmtr1Q9DBC3 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cmtr1Q9DBC3 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cmtr1Q9DBC3 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Cmtr1Q9DBC3 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Cmtr1Q9DBC3 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Cmtr1Q9DBC3 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cmtr1Q9DBC3 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cmtr1Q9DBC3 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cmtr1Q9DBC3 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cmtr1Q9DBC3 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cmtr1Q9DBC3 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cmtr1Q9DBC3 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cmtr1Q9DBC3 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cmtr1Q9DBC3 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cmtr1Q9DBC3 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cmtr1Q9DBC3 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cmtr1Q9DBC3 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cmtr1Q9DBC3 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cmtr1Q9DBC3 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cmtr1Q9DBC3 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Cmtr1Q9DBC3 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cmtr1Q9DBC3 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cmtr1Q9DBC3 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Cmtr1Q9DBC3 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cmtr1Q9DBC3 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cmtr1Q9DBC3 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cmtr1Q9DBC3 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cmtr1Q9DBC3 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cmtr1Q9DBC3 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cmtr1Q9DBC3 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cmtr1Q9DBC3 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cmtr1Q9DBC3 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Cmtr1Q9DBC3 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cmtr1Q9DBC3 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cmtr1Q9DBC3 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cmtr1Q9DBC3 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Cmtr1Q9DBC3 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cmtr1Q9DBC3 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cmtr1Q9DBC3 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cmtr1Q9DBC3 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cmtr1Q9DBC3 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cmtr1Q9DBC3 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cmtr1Q9DBC3 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cmtr1Q9DBC3 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cmtr1Q9DBC3 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cmtr1Q9DBC3 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cmtr1Q9DBC3 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cmtr1Q9DBC3 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cmtr1Q9DBC3 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cmtr1Q9DBC3 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cmtr1Q9DBC3 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cmtr1Q9DBC3 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cmtr1Q9DBC3 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cmtr1Q9DBC3 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cmtr1Q9DBC3 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cmtr1Q9DBC3 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cmtr1Q9DBC3 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cmtr1Q9DBC3 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cmtr1Q9DBC3 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cmtr1Q9DBC3 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cmtr1Q9DBC3 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cmtr1Q9DBC3 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cmtr1Q9DBC3 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cmtr1Q9DBC3 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Cmtr1Q9DBC3 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cmtr1Q9DBC3 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cmtr1Q9DBC3 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Cmtr1Q9DBC3 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cmtr1Q9DBC3 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cmtr1Q9DBC3 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Cmtr1Q9DBC3 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cmtr1Q9DBC3 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Cmtr1Q9DBC3 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cmtr1Q9DBC3 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cmtr1Q9DBC3 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Cmtr1Q9DBC3 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Cmtr1Q9DBC3 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.7 ms