Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB70

Fundc1, FUN14 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fundc1Q9DB70 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fundc1Q9DB70 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fundc1Q9DB70 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fundc1Q9DB70 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fundc1Q9DB70 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fundc1Q9DB70 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fundc1Q9DB70 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fundc1Q9DB70 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fundc1Q9DB70 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fundc1Q9DB70 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fundc1Q9DB70 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Fundc1Q9DB70 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fundc1Q9DB70 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fundc1Q9DB70 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fundc1Q9DB70 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fundc1Q9DB70 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fundc1Q9DB70 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fundc1Q9DB70 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fundc1Q9DB70 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fundc1Q9DB70 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fundc1Q9DB70 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fundc1Q9DB70 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fundc1Q9DB70 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Fundc1Q9DB70 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Fundc1Q9DB70 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Fundc1Q9DB70 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Fundc1Q9DB70 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Fundc1Q9DB70 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Fundc1Q9DB70 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Fundc1Q9DB70 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Fundc1Q9DB70 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Fundc1Q9DB70 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Fundc1Q9DB70 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Fundc1Q9DB70 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Fundc1Q9DB70 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Fundc1Q9DB70 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Fundc1Q9DB70 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Fundc1Q9DB70 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Fundc1Q9DB70 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Fundc1Q9DB70 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Fundc1Q9DB70 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Fundc1Q9DB70 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Fundc1Q9DB70 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Fundc1Q9DB70 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Fundc1Q9DB70 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Fundc1Q9DB70 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Fundc1Q9DB70 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Fundc1Q9DB70 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Fundc1Q9DB70 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Fundc1Q9DB70 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Fundc1Q9DB70 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Fundc1Q9DB70 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Fundc1Q9DB70 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Fundc1Q9DB70 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Fundc1Q9DB70 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Fundc1Q9DB70 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Fundc1Q9DB70 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Fundc1Q9DB70 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Fundc1Q9DB70 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Fundc1Q9DB70 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Fundc1Q9DB70 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Fundc1Q9DB70 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Fundc1Q9DB70 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Fundc1Q9DB70 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Fundc1Q9DB70 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Fundc1Q9DB70 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Fundc1Q9DB70 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Fundc1Q9DB70 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Fundc1Q9DB70 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Fundc1Q9DB70 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Fundc1Q9DB70 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Fundc1Q9DB70 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Fundc1Q9DB70 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Fundc1Q9DB70 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Fundc1Q9DB70 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Fundc1Q9DB70 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Fundc1Q9DB70 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Fundc1Q9DB70 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Fundc1Q9DB70 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Fundc1Q9DB70 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Fundc1Q9DB70 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Fundc1Q9DB70 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Fundc1Q9DB70 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Fundc1Q9DB70 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Fundc1Q9DB70 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Fundc1Q9DB70 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Fundc1Q9DB70 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Fundc1Q9DB70 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Fundc1Q9DB70 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Fundc1Q9DB70 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Fundc1Q9DB70 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Fundc1Q9DB70 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Fundc1Q9DB70 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Fundc1Q9DB70 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Fundc1Q9DB70 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Fundc1Q9DB70 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Fundc1Q9DB70 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Fundc1Q9DB70 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Fundc1Q9DB70 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Fundc1Q9DB70 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms