Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA80

Rsph3b, Radial spoke head protein 3 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph3bQ9DA80 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Rsph3bQ9DA80 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rsph3bQ9DA80 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rsph3bQ9DA80 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rsph3bQ9DA80 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rsph3bQ9DA80 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rsph3bQ9DA80 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rsph3bQ9DA80 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rsph3bQ9DA80 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rsph3bQ9DA80 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Rsph3bQ9DA80 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rsph3bQ9DA80 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rsph3bQ9DA80 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Rsph3bQ9DA80 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rsph3bQ9DA80 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rsph3bQ9DA80 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Rsph3bQ9DA80 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rsph3bQ9DA80 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rsph3bQ9DA80 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rsph3bQ9DA80 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rsph3bQ9DA80 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rsph3bQ9DA80 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rsph3bQ9DA80 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rsph3bQ9DA80 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rsph3bQ9DA80 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rsph3bQ9DA80 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rsph3bQ9DA80 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rsph3bQ9DA80 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rsph3bQ9DA80 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rsph3bQ9DA80 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rsph3bQ9DA80 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rsph3bQ9DA80 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rsph3bQ9DA80 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rsph3bQ9DA80 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rsph3bQ9DA80 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rsph3bQ9DA80 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rsph3bQ9DA80 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rsph3bQ9DA80 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rsph3bQ9DA80 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rsph3bQ9DA80 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rsph3bQ9DA80 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rsph3bQ9DA80 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rsph3bQ9DA80 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rsph3bQ9DA80 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rsph3bQ9DA80 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rsph3bQ9DA80 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rsph3bQ9DA80 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rsph3bQ9DA80 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Rsph3bQ9DA80 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rsph3bQ9DA80 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rsph3bQ9DA80 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rsph3bQ9DA80 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rsph3bQ9DA80 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rsph3bQ9DA80 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rsph3bQ9DA80 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rsph3bQ9DA80 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rsph3bQ9DA80 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Rsph3bQ9DA80 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rsph3bQ9DA80 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Rsph3bQ9DA80 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rsph3bQ9DA80 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rsph3bQ9DA80 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rsph3bQ9DA80 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rsph3bQ9DA80 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rsph3bQ9DA80 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rsph3bQ9DA80 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rsph3bQ9DA80 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rsph3bQ9DA80 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rsph3bQ9DA80 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rsph3bQ9DA80 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rsph3bQ9DA80 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rsph3bQ9DA80 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rsph3bQ9DA80 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rsph3bQ9DA80 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rsph3bQ9DA80 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rsph3bQ9DA80 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rsph3bQ9DA80 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rsph3bQ9DA80 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rsph3bQ9DA80 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rsph3bQ9DA80 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rsph3bQ9DA80 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rsph3bQ9DA80 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rsph3bQ9DA80 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rsph3bQ9DA80 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rsph3bQ9DA80 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Rsph3bQ9DA80 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rsph3bQ9DA80 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rsph3bQ9DA80 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rsph3bQ9DA80 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rsph3bQ9DA80 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rsph3bQ9DA80 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rsph3bQ9DA80 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rsph3bQ9DA80 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rsph3bQ9DA80 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rsph3bQ9DA80 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rsph3bQ9DA80 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rsph3bQ9DA80 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rsph3bQ9DA80 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rsph3bQ9DA80 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rsph3bQ9DA80 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms