Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9H8

UPF0565 protein C2orf69 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D9H8 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Q9D9H8 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Q9D9H8 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Q9D9H8 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Q9D9H8 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Q9D9H8 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Q9D9H8 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Q9D9H8 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Q9D9H8 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Q9D9H8 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Q9D9H8 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Q9D9H8 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Q9D9H8 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Q9D9H8 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Q9D9H8 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Q9D9H8 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Q9D9H8 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Q9D9H8 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Q9D9H8 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Q9D9H8 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Q9D9H8 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Q9D9H8 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Q9D9H8 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Q9D9H8 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Q9D9H8 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Q9D9H8 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Q9D9H8 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Q9D9H8 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Q9D9H8 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Q9D9H8 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Q9D9H8 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Q9D9H8 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Q9D9H8 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Q9D9H8 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Q9D9H8 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Q9D9H8 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Q9D9H8 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Q9D9H8 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Q9D9H8 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Q9D9H8 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Q9D9H8 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Q9D9H8 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Q9D9H8 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Q9D9H8 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Q9D9H8 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Q9D9H8 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Q9D9H8 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Q9D9H8 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Q9D9H8 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Q9D9H8 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Q9D9H8 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Q9D9H8 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Q9D9H8 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Q9D9H8 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Q9D9H8 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Q9D9H8 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Q9D9H8 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Q9D9H8 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Q9D9H8 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Q9D9H8 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Q9D9H8 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Q9D9H8 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Q9D9H8 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Q9D9H8 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Q9D9H8 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Q9D9H8 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Q9D9H8 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Q9D9H8 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Q9D9H8 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Q9D9H8 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Q9D9H8 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Q9D9H8 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Q9D9H8 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Q9D9H8 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Q9D9H8 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Q9D9H8 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Q9D9H8 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Q9D9H8 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Q9D9H8 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Q9D9H8 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Q9D9H8 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Q9D9H8 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Q9D9H8 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Q9D9H8 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Q9D9H8 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Q9D9H8 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Q9D9H8 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Q9D9H8 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Q9D9H8 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Q9D9H8 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Q9D9H8 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Q9D9H8 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Q9D9H8 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Q9D9H8 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Q9D9H8 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Q9D9H8 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Q9D9H8 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Q9D9H8 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Q9D9H8 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Q9D9H8 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms