Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9H2

Cldnd2, Claudin domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldnd2Q9D9H2 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldnd2Q9D9H2 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldnd2Q9D9H2 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldnd2Q9D9H2 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldnd2Q9D9H2 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldnd2Q9D9H2 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldnd2Q9D9H2 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldnd2Q9D9H2 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldnd2Q9D9H2 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldnd2Q9D9H2 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldnd2Q9D9H2 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldnd2Q9D9H2 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldnd2Q9D9H2 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldnd2Q9D9H2 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldnd2Q9D9H2 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldnd2Q9D9H2 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldnd2Q9D9H2 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldnd2Q9D9H2 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldnd2Q9D9H2 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldnd2Q9D9H2 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldnd2Q9D9H2 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldnd2Q9D9H2 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldnd2Q9D9H2 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldnd2Q9D9H2 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldnd2Q9D9H2 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldnd2Q9D9H2 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldnd2Q9D9H2 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldnd2Q9D9H2 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldnd2Q9D9H2 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldnd2Q9D9H2 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldnd2Q9D9H2 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldnd2Q9D9H2 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldnd2Q9D9H2 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldnd2Q9D9H2 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldnd2Q9D9H2 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldnd2Q9D9H2 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldnd2Q9D9H2 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldnd2Q9D9H2 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldnd2Q9D9H2 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldnd2Q9D9H2 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldnd2Q9D9H2 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldnd2Q9D9H2 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldnd2Q9D9H2 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldnd2Q9D9H2 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldnd2Q9D9H2 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldnd2Q9D9H2 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldnd2Q9D9H2 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldnd2Q9D9H2 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldnd2Q9D9H2 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldnd2Q9D9H2 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldnd2Q9D9H2 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldnd2Q9D9H2 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldnd2Q9D9H2 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldnd2Q9D9H2 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldnd2Q9D9H2 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldnd2Q9D9H2 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldnd2Q9D9H2 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldnd2Q9D9H2 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldnd2Q9D9H2 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldnd2Q9D9H2 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldnd2Q9D9H2 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldnd2Q9D9H2 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldnd2Q9D9H2 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldnd2Q9D9H2 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldnd2Q9D9H2 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldnd2Q9D9H2 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldnd2Q9D9H2 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldnd2Q9D9H2 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldnd2Q9D9H2 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldnd2Q9D9H2 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldnd2Q9D9H2 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldnd2Q9D9H2 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldnd2Q9D9H2 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldnd2Q9D9H2 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldnd2Q9D9H2 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldnd2Q9D9H2 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldnd2Q9D9H2 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldnd2Q9D9H2 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldnd2Q9D9H2 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldnd2Q9D9H2 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldnd2Q9D9H2 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldnd2Q9D9H2 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldnd2Q9D9H2 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldnd2Q9D9H2 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldnd2Q9D9H2 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldnd2Q9D9H2 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldnd2Q9D9H2 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldnd2Q9D9H2 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldnd2Q9D9H2 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldnd2Q9D9H2 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldnd2Q9D9H2 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldnd2Q9D9H2 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldnd2Q9D9H2 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldnd2Q9D9H2 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldnd2Q9D9H2 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cldnd2Q9D9H2 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cldnd2Q9D9H2 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cldnd2Q9D9H2 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cldnd2Q9D9H2 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cldnd2Q9D9H2 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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