Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8U3

Erp27, Endoplasmic reticulum resident protein 27, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Erp27Q9D8U3 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Erp27Q9D8U3 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Erp27Q9D8U3 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Erp27Q9D8U3 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Erp27Q9D8U3 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Erp27Q9D8U3 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Erp27Q9D8U3 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Erp27Q9D8U3 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Erp27Q9D8U3 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Erp27Q9D8U3 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Erp27Q9D8U3 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Erp27Q9D8U3 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Erp27Q9D8U3 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Erp27Q9D8U3 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Erp27Q9D8U3 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Erp27Q9D8U3 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Erp27Q9D8U3 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Erp27Q9D8U3 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Erp27Q9D8U3 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Erp27Q9D8U3 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Erp27Q9D8U3 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Erp27Q9D8U3 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Erp27Q9D8U3 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Erp27Q9D8U3 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Erp27Q9D8U3 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Erp27Q9D8U3 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Erp27Q9D8U3 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Erp27Q9D8U3 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Erp27Q9D8U3 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Erp27Q9D8U3 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Erp27Q9D8U3 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Erp27Q9D8U3 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Erp27Q9D8U3 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Erp27Q9D8U3 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Erp27Q9D8U3 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Erp27Q9D8U3 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Erp27Q9D8U3 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Erp27Q9D8U3 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Erp27Q9D8U3 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Erp27Q9D8U3 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Erp27Q9D8U3 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Erp27Q9D8U3 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Erp27Q9D8U3 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Erp27Q9D8U3 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Erp27Q9D8U3 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Erp27Q9D8U3 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Erp27Q9D8U3 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Erp27Q9D8U3 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Erp27Q9D8U3 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Erp27Q9D8U3 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Erp27Q9D8U3 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Erp27Q9D8U3 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Erp27Q9D8U3 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Erp27Q9D8U3 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Erp27Q9D8U3 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Erp27Q9D8U3 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Erp27Q9D8U3 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Erp27Q9D8U3 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Erp27Q9D8U3 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Erp27Q9D8U3 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Erp27Q9D8U3 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Erp27Q9D8U3 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Erp27Q9D8U3 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Erp27Q9D8U3 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Erp27Q9D8U3 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Erp27Q9D8U3 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Erp27Q9D8U3 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Erp27Q9D8U3 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Erp27Q9D8U3 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Erp27Q9D8U3 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Erp27Q9D8U3 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Erp27Q9D8U3 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Erp27Q9D8U3 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Erp27Q9D8U3 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Erp27Q9D8U3 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Erp27Q9D8U3 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Erp27Q9D8U3 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Erp27Q9D8U3 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Erp27Q9D8U3 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Erp27Q9D8U3 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Erp27Q9D8U3 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Erp27Q9D8U3 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Erp27Q9D8U3 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Erp27Q9D8U3 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Erp27Q9D8U3 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Erp27Q9D8U3 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Erp27Q9D8U3 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Erp27Q9D8U3 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Erp27Q9D8U3 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Erp27Q9D8U3 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Erp27Q9D8U3 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Erp27Q9D8U3 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Erp27Q9D8U3 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Erp27Q9D8U3 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Erp27Q9D8U3 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Erp27Q9D8U3 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Erp27Q9D8U3 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Erp27Q9D8U3 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Erp27Q9D8U3 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Erp27Q9D8U3 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms