Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8K3

Derl3, Derlin-3, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Derl3Q9D8K3 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Derl3Q9D8K3 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Derl3Q9D8K3 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Derl3Q9D8K3 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Derl3Q9D8K3 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Derl3Q9D8K3 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Derl3Q9D8K3 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Derl3Q9D8K3 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Derl3Q9D8K3 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Derl3Q9D8K3 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Derl3Q9D8K3 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Derl3Q9D8K3 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Derl3Q9D8K3 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Derl3Q9D8K3 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Derl3Q9D8K3 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Derl3Q9D8K3 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Derl3Q9D8K3 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Derl3Q9D8K3 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Derl3Q9D8K3 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Derl3Q9D8K3 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Derl3Q9D8K3 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Derl3Q9D8K3 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Derl3Q9D8K3 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Derl3Q9D8K3 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Derl3Q9D8K3 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Derl3Q9D8K3 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Derl3Q9D8K3 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Derl3Q9D8K3 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Derl3Q9D8K3 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Derl3Q9D8K3 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Derl3Q9D8K3 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Derl3Q9D8K3 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Derl3Q9D8K3 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Derl3Q9D8K3 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Derl3Q9D8K3 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Derl3Q9D8K3 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Derl3Q9D8K3 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Derl3Q9D8K3 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Derl3Q9D8K3 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Derl3Q9D8K3 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Derl3Q9D8K3 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Derl3Q9D8K3 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Derl3Q9D8K3 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Derl3Q9D8K3 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Derl3Q9D8K3 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Derl3Q9D8K3 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Derl3Q9D8K3 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Derl3Q9D8K3 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Derl3Q9D8K3 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Derl3Q9D8K3 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Derl3Q9D8K3 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Derl3Q9D8K3 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Derl3Q9D8K3 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Derl3Q9D8K3 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Derl3Q9D8K3 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Derl3Q9D8K3 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Derl3Q9D8K3 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Derl3Q9D8K3 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Derl3Q9D8K3 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Derl3Q9D8K3 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Derl3Q9D8K3 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Derl3Q9D8K3 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Derl3Q9D8K3 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Derl3Q9D8K3 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Derl3Q9D8K3 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Derl3Q9D8K3 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Derl3Q9D8K3 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Derl3Q9D8K3 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Derl3Q9D8K3 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Derl3Q9D8K3 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Derl3Q9D8K3 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Derl3Q9D8K3 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Derl3Q9D8K3 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Derl3Q9D8K3 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Derl3Q9D8K3 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Derl3Q9D8K3 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Derl3Q9D8K3 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Derl3Q9D8K3 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Derl3Q9D8K3 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Derl3Q9D8K3 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Derl3Q9D8K3 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Derl3Q9D8K3 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Derl3Q9D8K3 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Derl3Q9D8K3 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Derl3Q9D8K3 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Derl3Q9D8K3 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Derl3Q9D8K3 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Derl3Q9D8K3 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Derl3Q9D8K3 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Derl3Q9D8K3 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Derl3Q9D8K3 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Derl3Q9D8K3 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Derl3Q9D8K3 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Derl3Q9D8K3 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Derl3Q9D8K3 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Derl3Q9D8K3 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Derl3Q9D8K3 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Derl3Q9D8K3 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Derl3Q9D8K3 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Derl3Q9D8K3 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms