Protein–RNA interactions for Protein: Q9D883

U2af1, Splicing factor U2AF 35 kDa subunit, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2af1Q9D883 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
U2af1Q9D883 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
U2af1Q9D883 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
U2af1Q9D883 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
U2af1Q9D883 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
U2af1Q9D883 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
U2af1Q9D883 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
U2af1Q9D883 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
U2af1Q9D883 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
U2af1Q9D883 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
U2af1Q9D883 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
U2af1Q9D883 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
U2af1Q9D883 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
U2af1Q9D883 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
U2af1Q9D883 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
U2af1Q9D883 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
U2af1Q9D883 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
U2af1Q9D883 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
U2af1Q9D883 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
U2af1Q9D883 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
U2af1Q9D883 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
U2af1Q9D883 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
U2af1Q9D883 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
U2af1Q9D883 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
U2af1Q9D883 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
U2af1Q9D883 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
U2af1Q9D883 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
U2af1Q9D883 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
U2af1Q9D883 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
U2af1Q9D883 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
U2af1Q9D883 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
U2af1Q9D883 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
U2af1Q9D883 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
U2af1Q9D883 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
U2af1Q9D883 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
U2af1Q9D883 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
U2af1Q9D883 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
U2af1Q9D883 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
U2af1Q9D883 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
U2af1Q9D883 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
U2af1Q9D883 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
U2af1Q9D883 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
U2af1Q9D883 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
U2af1Q9D883 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
U2af1Q9D883 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
U2af1Q9D883 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
U2af1Q9D883 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
U2af1Q9D883 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
U2af1Q9D883 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
U2af1Q9D883 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
U2af1Q9D883 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
U2af1Q9D883 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
U2af1Q9D883 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
U2af1Q9D883 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
U2af1Q9D883 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
U2af1Q9D883 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
U2af1Q9D883 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
U2af1Q9D883 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
U2af1Q9D883 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
U2af1Q9D883 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
U2af1Q9D883 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
U2af1Q9D883 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
U2af1Q9D883 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
U2af1Q9D883 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
U2af1Q9D883 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
U2af1Q9D883 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
U2af1Q9D883 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
U2af1Q9D883 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
U2af1Q9D883 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
U2af1Q9D883 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
U2af1Q9D883 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
U2af1Q9D883 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
U2af1Q9D883 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
U2af1Q9D883 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
U2af1Q9D883 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
U2af1Q9D883 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
U2af1Q9D883 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
U2af1Q9D883 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
U2af1Q9D883 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
U2af1Q9D883 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
U2af1Q9D883 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
U2af1Q9D883 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
U2af1Q9D883 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
U2af1Q9D883 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
U2af1Q9D883 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
U2af1Q9D883 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
U2af1Q9D883 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
U2af1Q9D883 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
U2af1Q9D883 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
U2af1Q9D883 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
U2af1Q9D883 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
U2af1Q9D883 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
U2af1Q9D883 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
U2af1Q9D883 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
U2af1Q9D883 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
U2af1Q9D883 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
U2af1Q9D883 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
U2af1Q9D883 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
U2af1Q9D883 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
U2af1Q9D883 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms