Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7U6

Cldn22, Claudin-22, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn22Q9D7U6 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cldn22Q9D7U6 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cldn22Q9D7U6 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cldn22Q9D7U6 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cldn22Q9D7U6 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cldn22Q9D7U6 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cldn22Q9D7U6 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cldn22Q9D7U6 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cldn22Q9D7U6 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Cldn22Q9D7U6 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cldn22Q9D7U6 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cldn22Q9D7U6 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cldn22Q9D7U6 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cldn22Q9D7U6 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cldn22Q9D7U6 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cldn22Q9D7U6 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cldn22Q9D7U6 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cldn22Q9D7U6 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cldn22Q9D7U6 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cldn22Q9D7U6 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cldn22Q9D7U6 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cldn22Q9D7U6 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cldn22Q9D7U6 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cldn22Q9D7U6 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Cldn22Q9D7U6 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cldn22Q9D7U6 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cldn22Q9D7U6 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cldn22Q9D7U6 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cldn22Q9D7U6 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cldn22Q9D7U6 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cldn22Q9D7U6 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Cldn22Q9D7U6 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cldn22Q9D7U6 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cldn22Q9D7U6 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cldn22Q9D7U6 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cldn22Q9D7U6 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cldn22Q9D7U6 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cldn22Q9D7U6 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cldn22Q9D7U6 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cldn22Q9D7U6 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cldn22Q9D7U6 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cldn22Q9D7U6 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cldn22Q9D7U6 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cldn22Q9D7U6 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cldn22Q9D7U6 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cldn22Q9D7U6 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cldn22Q9D7U6 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cldn22Q9D7U6 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cldn22Q9D7U6 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cldn22Q9D7U6 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cldn22Q9D7U6 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cldn22Q9D7U6 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cldn22Q9D7U6 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cldn22Q9D7U6 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cldn22Q9D7U6 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cldn22Q9D7U6 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cldn22Q9D7U6 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Cldn22Q9D7U6 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cldn22Q9D7U6 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cldn22Q9D7U6 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cldn22Q9D7U6 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cldn22Q9D7U6 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cldn22Q9D7U6 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cldn22Q9D7U6 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cldn22Q9D7U6 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cldn22Q9D7U6 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
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Cldn22Q9D7U6 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cldn22Q9D7U6 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cldn22Q9D7U6 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cldn22Q9D7U6 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cldn22Q9D7U6 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cldn22Q9D7U6 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cldn22Q9D7U6 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cldn22Q9D7U6 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cldn22Q9D7U6 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cldn22Q9D7U6 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cldn22Q9D7U6 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cldn22Q9D7U6 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cldn22Q9D7U6 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cldn22Q9D7U6 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cldn22Q9D7U6 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cldn22Q9D7U6 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cldn22Q9D7U6 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Cldn22Q9D7U6 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cldn22Q9D7U6 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Cldn22Q9D7U6 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cldn22Q9D7U6 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cldn22Q9D7U6 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cldn22Q9D7U6 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cldn22Q9D7U6 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cldn22Q9D7U6 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cldn22Q9D7U6 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cldn22Q9D7U6 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cldn22Q9D7U6 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cldn22Q9D7U6 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cldn22Q9D7U6 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cldn22Q9D7U6 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cldn22Q9D7U6 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cldn22Q9D7U6 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms