Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7S1

Tmem54, Transmembrane protein 54, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem54Q9D7S1 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmem54Q9D7S1 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmem54Q9D7S1 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmem54Q9D7S1 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmem54Q9D7S1 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmem54Q9D7S1 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmem54Q9D7S1 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmem54Q9D7S1 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmem54Q9D7S1 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmem54Q9D7S1 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmem54Q9D7S1 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmem54Q9D7S1 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmem54Q9D7S1 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmem54Q9D7S1 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmem54Q9D7S1 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmem54Q9D7S1 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmem54Q9D7S1 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmem54Q9D7S1 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmem54Q9D7S1 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmem54Q9D7S1 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmem54Q9D7S1 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmem54Q9D7S1 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmem54Q9D7S1 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmem54Q9D7S1 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmem54Q9D7S1 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmem54Q9D7S1 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmem54Q9D7S1 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmem54Q9D7S1 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmem54Q9D7S1 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmem54Q9D7S1 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmem54Q9D7S1 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmem54Q9D7S1 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmem54Q9D7S1 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmem54Q9D7S1 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmem54Q9D7S1 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmem54Q9D7S1 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmem54Q9D7S1 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmem54Q9D7S1 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmem54Q9D7S1 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmem54Q9D7S1 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmem54Q9D7S1 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmem54Q9D7S1 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmem54Q9D7S1 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmem54Q9D7S1 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmem54Q9D7S1 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmem54Q9D7S1 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmem54Q9D7S1 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmem54Q9D7S1 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmem54Q9D7S1 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmem54Q9D7S1 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmem54Q9D7S1 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmem54Q9D7S1 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmem54Q9D7S1 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Tmem54Q9D7S1 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Tmem54Q9D7S1 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmem54Q9D7S1 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmem54Q9D7S1 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmem54Q9D7S1 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmem54Q9D7S1 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmem54Q9D7S1 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Tmem54Q9D7S1 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmem54Q9D7S1 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmem54Q9D7S1 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmem54Q9D7S1 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Tmem54Q9D7S1 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmem54Q9D7S1 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmem54Q9D7S1 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmem54Q9D7S1 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmem54Q9D7S1 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmem54Q9D7S1 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tmem54Q9D7S1 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tmem54Q9D7S1 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tmem54Q9D7S1 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tmem54Q9D7S1 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tmem54Q9D7S1 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tmem54Q9D7S1 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tmem54Q9D7S1 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tmem54Q9D7S1 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tmem54Q9D7S1 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tmem54Q9D7S1 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tmem54Q9D7S1 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tmem54Q9D7S1 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tmem54Q9D7S1 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tmem54Q9D7S1 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Tmem54Q9D7S1 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tmem54Q9D7S1 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tmem54Q9D7S1 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tmem54Q9D7S1 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tmem54Q9D7S1 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tmem54Q9D7S1 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tmem54Q9D7S1 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tmem54Q9D7S1 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tmem54Q9D7S1 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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