Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7I0

Shisa5, Protein shisa-5, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisa5Q9D7I0 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Shisa5Q9D7I0 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Shisa5Q9D7I0 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Shisa5Q9D7I0 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Shisa5Q9D7I0 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Shisa5Q9D7I0 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Shisa5Q9D7I0 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Shisa5Q9D7I0 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Shisa5Q9D7I0 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Shisa5Q9D7I0 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Shisa5Q9D7I0 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Shisa5Q9D7I0 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Shisa5Q9D7I0 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Shisa5Q9D7I0 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Shisa5Q9D7I0 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Shisa5Q9D7I0 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Shisa5Q9D7I0 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Shisa5Q9D7I0 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Shisa5Q9D7I0 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Shisa5Q9D7I0 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Shisa5Q9D7I0 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Shisa5Q9D7I0 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Shisa5Q9D7I0 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Shisa5Q9D7I0 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Shisa5Q9D7I0 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Shisa5Q9D7I0 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Shisa5Q9D7I0 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Shisa5Q9D7I0 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Shisa5Q9D7I0 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Shisa5Q9D7I0 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Shisa5Q9D7I0 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Shisa5Q9D7I0 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Shisa5Q9D7I0 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Shisa5Q9D7I0 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Shisa5Q9D7I0 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Shisa5Q9D7I0 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Shisa5Q9D7I0 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Shisa5Q9D7I0 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Shisa5Q9D7I0 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Shisa5Q9D7I0 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Shisa5Q9D7I0 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Shisa5Q9D7I0 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Shisa5Q9D7I0 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Shisa5Q9D7I0 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Shisa5Q9D7I0 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Shisa5Q9D7I0 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Shisa5Q9D7I0 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Shisa5Q9D7I0 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Shisa5Q9D7I0 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Shisa5Q9D7I0 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Shisa5Q9D7I0 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Shisa5Q9D7I0 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Shisa5Q9D7I0 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Shisa5Q9D7I0 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Shisa5Q9D7I0 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Shisa5Q9D7I0 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Shisa5Q9D7I0 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Shisa5Q9D7I0 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Shisa5Q9D7I0 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Shisa5Q9D7I0 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Shisa5Q9D7I0 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Shisa5Q9D7I0 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Shisa5Q9D7I0 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Shisa5Q9D7I0 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Shisa5Q9D7I0 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Shisa5Q9D7I0 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Shisa5Q9D7I0 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Shisa5Q9D7I0 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Shisa5Q9D7I0 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Shisa5Q9D7I0 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Shisa5Q9D7I0 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Shisa5Q9D7I0 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Shisa5Q9D7I0 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Shisa5Q9D7I0 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Shisa5Q9D7I0 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Shisa5Q9D7I0 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Shisa5Q9D7I0 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Shisa5Q9D7I0 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Shisa5Q9D7I0 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Shisa5Q9D7I0 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Shisa5Q9D7I0 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Shisa5Q9D7I0 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Shisa5Q9D7I0 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Shisa5Q9D7I0 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Shisa5Q9D7I0 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Shisa5Q9D7I0 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Shisa5Q9D7I0 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Shisa5Q9D7I0 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Shisa5Q9D7I0 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Shisa5Q9D7I0 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Shisa5Q9D7I0 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Shisa5Q9D7I0 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Shisa5Q9D7I0 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Shisa5Q9D7I0 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Shisa5Q9D7I0 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Shisa5Q9D7I0 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Shisa5Q9D7I0 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Shisa5Q9D7I0 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Shisa5Q9D7I0 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Shisa5Q9D7I0 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms