Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Y9

Gbe1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, mousemouse

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbe1Q9D6Y9 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gbe1Q9D6Y9 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gbe1Q9D6Y9 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gbe1Q9D6Y9 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gbe1Q9D6Y9 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gbe1Q9D6Y9 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gbe1Q9D6Y9 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gbe1Q9D6Y9 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gbe1Q9D6Y9 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gbe1Q9D6Y9 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gbe1Q9D6Y9 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gbe1Q9D6Y9 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gbe1Q9D6Y9 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Gbe1Q9D6Y9 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gbe1Q9D6Y9 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gbe1Q9D6Y9 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gbe1Q9D6Y9 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gbe1Q9D6Y9 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gbe1Q9D6Y9 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Gbe1Q9D6Y9 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Gbe1Q9D6Y9 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gbe1Q9D6Y9 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gbe1Q9D6Y9 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gbe1Q9D6Y9 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gbe1Q9D6Y9 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gbe1Q9D6Y9 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gbe1Q9D6Y9 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gbe1Q9D6Y9 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gbe1Q9D6Y9 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gbe1Q9D6Y9 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gbe1Q9D6Y9 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gbe1Q9D6Y9 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gbe1Q9D6Y9 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gbe1Q9D6Y9 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gbe1Q9D6Y9 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gbe1Q9D6Y9 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gbe1Q9D6Y9 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gbe1Q9D6Y9 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Gbe1Q9D6Y9 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gbe1Q9D6Y9 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gbe1Q9D6Y9 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gbe1Q9D6Y9 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Gbe1Q9D6Y9 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gbe1Q9D6Y9 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gbe1Q9D6Y9 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gbe1Q9D6Y9 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gbe1Q9D6Y9 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gbe1Q9D6Y9 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gbe1Q9D6Y9 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gbe1Q9D6Y9 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gbe1Q9D6Y9 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gbe1Q9D6Y9 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gbe1Q9D6Y9 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gbe1Q9D6Y9 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gbe1Q9D6Y9 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gbe1Q9D6Y9 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gbe1Q9D6Y9 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gbe1Q9D6Y9 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gbe1Q9D6Y9 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Gbe1Q9D6Y9 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gbe1Q9D6Y9 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gbe1Q9D6Y9 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gbe1Q9D6Y9 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gbe1Q9D6Y9 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Gbe1Q9D6Y9 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gbe1Q9D6Y9 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Gbe1Q9D6Y9 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gbe1Q9D6Y9 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gbe1Q9D6Y9 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gbe1Q9D6Y9 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gbe1Q9D6Y9 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gbe1Q9D6Y9 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gbe1Q9D6Y9 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Gbe1Q9D6Y9 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gbe1Q9D6Y9 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gbe1Q9D6Y9 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gbe1Q9D6Y9 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gbe1Q9D6Y9 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gbe1Q9D6Y9 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gbe1Q9D6Y9 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gbe1Q9D6Y9 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gbe1Q9D6Y9 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gbe1Q9D6Y9 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gbe1Q9D6Y9 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gbe1Q9D6Y9 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gbe1Q9D6Y9 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gbe1Q9D6Y9 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gbe1Q9D6Y9 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gbe1Q9D6Y9 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gbe1Q9D6Y9 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gbe1Q9D6Y9 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Gbe1Q9D6Y9 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gbe1Q9D6Y9 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gbe1Q9D6Y9 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gbe1Q9D6Y9 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gbe1Q9D6Y9 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gbe1Q9D6Y9 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gbe1Q9D6Y9 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Gbe1Q9D6Y9 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gbe1Q9D6Y9 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms