Protein–RNA interactions for Protein: Q9D620

Rab11fip1, Rab11 family-interacting protein 1, mousemouse

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Length 645 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip1Q9D620 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rab11fip1Q9D620 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rab11fip1Q9D620 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rab11fip1Q9D620 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Rab11fip1Q9D620 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rab11fip1Q9D620 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Rab11fip1Q9D620 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rab11fip1Q9D620 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rab11fip1Q9D620 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Rab11fip1Q9D620 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rab11fip1Q9D620 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rab11fip1Q9D620 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rab11fip1Q9D620 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rab11fip1Q9D620 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rab11fip1Q9D620 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rab11fip1Q9D620 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rab11fip1Q9D620 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rab11fip1Q9D620 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rab11fip1Q9D620 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rab11fip1Q9D620 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rab11fip1Q9D620 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rab11fip1Q9D620 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rab11fip1Q9D620 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rab11fip1Q9D620 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rab11fip1Q9D620 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rab11fip1Q9D620 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rab11fip1Q9D620 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rab11fip1Q9D620 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Rab11fip1Q9D620 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
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Rab11fip1Q9D620 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rab11fip1Q9D620 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rab11fip1Q9D620 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Rab11fip1Q9D620 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rab11fip1Q9D620 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rab11fip1Q9D620 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rab11fip1Q9D620 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rab11fip1Q9D620 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rab11fip1Q9D620 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rab11fip1Q9D620 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rab11fip1Q9D620 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
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Rab11fip1Q9D620 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rab11fip1Q9D620 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Rab11fip1Q9D620 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
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Rab11fip1Q9D620 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rab11fip1Q9D620 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
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Rab11fip1Q9D620 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rab11fip1Q9D620 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
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Rab11fip1Q9D620 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rab11fip1Q9D620 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
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Rab11fip1Q9D620 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rab11fip1Q9D620 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
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Rab11fip1Q9D620 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
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Rab11fip1Q9D620 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
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Rab11fip1Q9D620 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rab11fip1Q9D620 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rab11fip1Q9D620 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rab11fip1Q9D620 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rab11fip1Q9D620 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rab11fip1Q9D620 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rab11fip1Q9D620 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rab11fip1Q9D620 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rab11fip1Q9D620 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rab11fip1Q9D620 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rab11fip1Q9D620 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rab11fip1Q9D620 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rab11fip1Q9D620 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
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Rab11fip1Q9D620 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
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Rab11fip1Q9D620 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rab11fip1Q9D620 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rab11fip1Q9D620 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rab11fip1Q9D620 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
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