Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5W4

Ccdc81, Coiled-coil domain-containing protein 81, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc81Q9D5W4 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc81Q9D5W4 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc81Q9D5W4 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc81Q9D5W4 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc81Q9D5W4 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc81Q9D5W4 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc81Q9D5W4 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc81Q9D5W4 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc81Q9D5W4 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc81Q9D5W4 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc81Q9D5W4 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc81Q9D5W4 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc81Q9D5W4 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc81Q9D5W4 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc81Q9D5W4 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc81Q9D5W4 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc81Q9D5W4 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc81Q9D5W4 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc81Q9D5W4 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc81Q9D5W4 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc81Q9D5W4 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc81Q9D5W4 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc81Q9D5W4 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc81Q9D5W4 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc81Q9D5W4 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc81Q9D5W4 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc81Q9D5W4 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc81Q9D5W4 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc81Q9D5W4 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc81Q9D5W4 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc81Q9D5W4 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc81Q9D5W4 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc81Q9D5W4 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc81Q9D5W4 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc81Q9D5W4 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc81Q9D5W4 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc81Q9D5W4 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc81Q9D5W4 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc81Q9D5W4 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc81Q9D5W4 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc81Q9D5W4 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc81Q9D5W4 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc81Q9D5W4 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc81Q9D5W4 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc81Q9D5W4 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc81Q9D5W4 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc81Q9D5W4 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc81Q9D5W4 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc81Q9D5W4 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc81Q9D5W4 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc81Q9D5W4 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc81Q9D5W4 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc81Q9D5W4 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc81Q9D5W4 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc81Q9D5W4 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc81Q9D5W4 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc81Q9D5W4 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc81Q9D5W4 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc81Q9D5W4 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc81Q9D5W4 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc81Q9D5W4 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc81Q9D5W4 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc81Q9D5W4 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc81Q9D5W4 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc81Q9D5W4 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc81Q9D5W4 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc81Q9D5W4 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc81Q9D5W4 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc81Q9D5W4 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc81Q9D5W4 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc81Q9D5W4 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc81Q9D5W4 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc81Q9D5W4 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc81Q9D5W4 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc81Q9D5W4 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc81Q9D5W4 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc81Q9D5W4 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc81Q9D5W4 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc81Q9D5W4 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc81Q9D5W4 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc81Q9D5W4 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc81Q9D5W4 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc81Q9D5W4 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc81Q9D5W4 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc81Q9D5W4 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc81Q9D5W4 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc81Q9D5W4 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc81Q9D5W4 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc81Q9D5W4 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc81Q9D5W4 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc81Q9D5W4 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc81Q9D5W4 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc81Q9D5W4 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc81Q9D5W4 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc81Q9D5W4 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc81Q9D5W4 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc81Q9D5W4 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc81Q9D5W4 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc81Q9D5W4 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc81Q9D5W4 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms