Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5U5

Pudp, Pseudouridine-5'-phosphatase, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PudpQ9D5U5 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PudpQ9D5U5 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PudpQ9D5U5 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PudpQ9D5U5 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PudpQ9D5U5 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PudpQ9D5U5 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PudpQ9D5U5 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PudpQ9D5U5 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PudpQ9D5U5 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PudpQ9D5U5 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PudpQ9D5U5 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PudpQ9D5U5 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PudpQ9D5U5 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PudpQ9D5U5 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PudpQ9D5U5 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PudpQ9D5U5 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PudpQ9D5U5 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PudpQ9D5U5 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PudpQ9D5U5 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PudpQ9D5U5 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PudpQ9D5U5 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PudpQ9D5U5 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PudpQ9D5U5 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PudpQ9D5U5 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PudpQ9D5U5 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PudpQ9D5U5 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PudpQ9D5U5 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PudpQ9D5U5 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PudpQ9D5U5 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PudpQ9D5U5 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PudpQ9D5U5 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PudpQ9D5U5 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PudpQ9D5U5 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PudpQ9D5U5 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PudpQ9D5U5 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PudpQ9D5U5 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PudpQ9D5U5 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PudpQ9D5U5 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PudpQ9D5U5 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PudpQ9D5U5 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PudpQ9D5U5 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PudpQ9D5U5 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PudpQ9D5U5 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PudpQ9D5U5 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PudpQ9D5U5 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PudpQ9D5U5 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PudpQ9D5U5 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PudpQ9D5U5 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PudpQ9D5U5 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PudpQ9D5U5 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PudpQ9D5U5 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PudpQ9D5U5 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PudpQ9D5U5 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PudpQ9D5U5 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PudpQ9D5U5 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PudpQ9D5U5 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PudpQ9D5U5 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PudpQ9D5U5 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PudpQ9D5U5 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PudpQ9D5U5 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PudpQ9D5U5 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PudpQ9D5U5 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PudpQ9D5U5 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PudpQ9D5U5 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PudpQ9D5U5 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
PudpQ9D5U5 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PudpQ9D5U5 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PudpQ9D5U5 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PudpQ9D5U5 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PudpQ9D5U5 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PudpQ9D5U5 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PudpQ9D5U5 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PudpQ9D5U5 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PudpQ9D5U5 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PudpQ9D5U5 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PudpQ9D5U5 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PudpQ9D5U5 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PudpQ9D5U5 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PudpQ9D5U5 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PudpQ9D5U5 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PudpQ9D5U5 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PudpQ9D5U5 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PudpQ9D5U5 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PudpQ9D5U5 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PudpQ9D5U5 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PudpQ9D5U5 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PudpQ9D5U5 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PudpQ9D5U5 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PudpQ9D5U5 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PudpQ9D5U5 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PudpQ9D5U5 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PudpQ9D5U5 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PudpQ9D5U5 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PudpQ9D5U5 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PudpQ9D5U5 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PudpQ9D5U5 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PudpQ9D5U5 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PudpQ9D5U5 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PudpQ9D5U5 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PudpQ9D5U5 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms