Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5Q6

Speer4f1, MCG6381, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer4f1Q9D5Q6 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Speer4f1Q9D5Q6 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Speer4f1Q9D5Q6 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Speer4f1Q9D5Q6 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Speer4f1Q9D5Q6 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Speer4f1Q9D5Q6 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Speer4f1Q9D5Q6 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Speer4f1Q9D5Q6 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Speer4f1Q9D5Q6 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Speer4f1Q9D5Q6 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Speer4f1Q9D5Q6 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Speer4f1Q9D5Q6 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Speer4f1Q9D5Q6 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Speer4f1Q9D5Q6 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Speer4f1Q9D5Q6 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Speer4f1Q9D5Q6 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Speer4f1Q9D5Q6 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Speer4f1Q9D5Q6 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Speer4f1Q9D5Q6 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Speer4f1Q9D5Q6 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Speer4f1Q9D5Q6 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Speer4f1Q9D5Q6 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Speer4f1Q9D5Q6 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Speer4f1Q9D5Q6 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Speer4f1Q9D5Q6 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Speer4f1Q9D5Q6 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Speer4f1Q9D5Q6 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Speer4f1Q9D5Q6 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Speer4f1Q9D5Q6 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Speer4f1Q9D5Q6 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Speer4f1Q9D5Q6 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Speer4f1Q9D5Q6 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Speer4f1Q9D5Q6 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Speer4f1Q9D5Q6 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Speer4f1Q9D5Q6 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Speer4f1Q9D5Q6 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Speer4f1Q9D5Q6 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Speer4f1Q9D5Q6 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Speer4f1Q9D5Q6 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Speer4f1Q9D5Q6 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Speer4f1Q9D5Q6 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Speer4f1Q9D5Q6 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Speer4f1Q9D5Q6 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Speer4f1Q9D5Q6 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Speer4f1Q9D5Q6 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Speer4f1Q9D5Q6 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Speer4f1Q9D5Q6 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Speer4f1Q9D5Q6 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Speer4f1Q9D5Q6 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Speer4f1Q9D5Q6 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Speer4f1Q9D5Q6 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Speer4f1Q9D5Q6 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Speer4f1Q9D5Q6 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Speer4f1Q9D5Q6 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Speer4f1Q9D5Q6 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Speer4f1Q9D5Q6 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Speer4f1Q9D5Q6 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Speer4f1Q9D5Q6 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Speer4f1Q9D5Q6 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Speer4f1Q9D5Q6 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Speer4f1Q9D5Q6 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Speer4f1Q9D5Q6 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Speer4f1Q9D5Q6 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Speer4f1Q9D5Q6 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Speer4f1Q9D5Q6 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Speer4f1Q9D5Q6 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Speer4f1Q9D5Q6 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Speer4f1Q9D5Q6 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Speer4f1Q9D5Q6 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Speer4f1Q9D5Q6 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Speer4f1Q9D5Q6 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Speer4f1Q9D5Q6 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Speer4f1Q9D5Q6 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Speer4f1Q9D5Q6 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Speer4f1Q9D5Q6 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Speer4f1Q9D5Q6 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Speer4f1Q9D5Q6 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Speer4f1Q9D5Q6 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Speer4f1Q9D5Q6 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Speer4f1Q9D5Q6 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Speer4f1Q9D5Q6 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Speer4f1Q9D5Q6 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Speer4f1Q9D5Q6 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Speer4f1Q9D5Q6 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Speer4f1Q9D5Q6 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Speer4f1Q9D5Q6 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Speer4f1Q9D5Q6 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Speer4f1Q9D5Q6 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Speer4f1Q9D5Q6 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Speer4f1Q9D5Q6 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Speer4f1Q9D5Q6 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Speer4f1Q9D5Q6 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Speer4f1Q9D5Q6 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Speer4f1Q9D5Q6 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Speer4f1Q9D5Q6 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Speer4f1Q9D5Q6 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Speer4f1Q9D5Q6 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Speer4f1Q9D5Q6 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Speer4f1Q9D5Q6 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Speer4f1Q9D5Q6 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms