Protein–RNA interactions for Protein: Q9D554

Sf3a3, Splicing factor 3A subunit 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3a3Q9D554 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sf3a3Q9D554 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sf3a3Q9D554 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sf3a3Q9D554 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sf3a3Q9D554 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sf3a3Q9D554 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sf3a3Q9D554 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sf3a3Q9D554 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sf3a3Q9D554 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sf3a3Q9D554 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sf3a3Q9D554 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sf3a3Q9D554 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sf3a3Q9D554 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sf3a3Q9D554 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sf3a3Q9D554 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sf3a3Q9D554 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sf3a3Q9D554 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sf3a3Q9D554 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sf3a3Q9D554 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sf3a3Q9D554 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sf3a3Q9D554 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sf3a3Q9D554 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sf3a3Q9D554 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sf3a3Q9D554 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sf3a3Q9D554 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sf3a3Q9D554 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sf3a3Q9D554 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sf3a3Q9D554 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sf3a3Q9D554 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sf3a3Q9D554 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sf3a3Q9D554 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sf3a3Q9D554 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sf3a3Q9D554 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sf3a3Q9D554 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sf3a3Q9D554 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sf3a3Q9D554 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sf3a3Q9D554 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sf3a3Q9D554 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sf3a3Q9D554 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sf3a3Q9D554 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sf3a3Q9D554 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sf3a3Q9D554 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sf3a3Q9D554 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sf3a3Q9D554 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Sf3a3Q9D554 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sf3a3Q9D554 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sf3a3Q9D554 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sf3a3Q9D554 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sf3a3Q9D554 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sf3a3Q9D554 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sf3a3Q9D554 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sf3a3Q9D554 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sf3a3Q9D554 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sf3a3Q9D554 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sf3a3Q9D554 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sf3a3Q9D554 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sf3a3Q9D554 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sf3a3Q9D554 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sf3a3Q9D554 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sf3a3Q9D554 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sf3a3Q9D554 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sf3a3Q9D554 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sf3a3Q9D554 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sf3a3Q9D554 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sf3a3Q9D554 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sf3a3Q9D554 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sf3a3Q9D554 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sf3a3Q9D554 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sf3a3Q9D554 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sf3a3Q9D554 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sf3a3Q9D554 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sf3a3Q9D554 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sf3a3Q9D554 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sf3a3Q9D554 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Sf3a3Q9D554 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Sf3a3Q9D554 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sf3a3Q9D554 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sf3a3Q9D554 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sf3a3Q9D554 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sf3a3Q9D554 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sf3a3Q9D554 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sf3a3Q9D554 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sf3a3Q9D554 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sf3a3Q9D554 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sf3a3Q9D554 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sf3a3Q9D554 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sf3a3Q9D554 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sf3a3Q9D554 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sf3a3Q9D554 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sf3a3Q9D554 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sf3a3Q9D554 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sf3a3Q9D554 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sf3a3Q9D554 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sf3a3Q9D554 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sf3a3Q9D554 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sf3a3Q9D554 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sf3a3Q9D554 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sf3a3Q9D554 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Sf3a3Q9D554 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sf3a3Q9D554 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms