Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4Z5

Prame, Preferentially-expressed antigen in melanoma, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrameQ9D4Z5 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PrameQ9D4Z5 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PrameQ9D4Z5 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PrameQ9D4Z5 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PrameQ9D4Z5 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PrameQ9D4Z5 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PrameQ9D4Z5 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PrameQ9D4Z5 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PrameQ9D4Z5 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PrameQ9D4Z5 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PrameQ9D4Z5 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PrameQ9D4Z5 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PrameQ9D4Z5 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PrameQ9D4Z5 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PrameQ9D4Z5 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PrameQ9D4Z5 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PrameQ9D4Z5 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PrameQ9D4Z5 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PrameQ9D4Z5 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PrameQ9D4Z5 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PrameQ9D4Z5 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PrameQ9D4Z5 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PrameQ9D4Z5 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PrameQ9D4Z5 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PrameQ9D4Z5 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PrameQ9D4Z5 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PrameQ9D4Z5 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PrameQ9D4Z5 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PrameQ9D4Z5 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PrameQ9D4Z5 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PrameQ9D4Z5 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PrameQ9D4Z5 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PrameQ9D4Z5 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PrameQ9D4Z5 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PrameQ9D4Z5 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PrameQ9D4Z5 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PrameQ9D4Z5 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PrameQ9D4Z5 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PrameQ9D4Z5 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PrameQ9D4Z5 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PrameQ9D4Z5 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PrameQ9D4Z5 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PrameQ9D4Z5 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PrameQ9D4Z5 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PrameQ9D4Z5 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PrameQ9D4Z5 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PrameQ9D4Z5 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PrameQ9D4Z5 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PrameQ9D4Z5 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PrameQ9D4Z5 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PrameQ9D4Z5 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PrameQ9D4Z5 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PrameQ9D4Z5 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PrameQ9D4Z5 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PrameQ9D4Z5 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PrameQ9D4Z5 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PrameQ9D4Z5 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PrameQ9D4Z5 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PrameQ9D4Z5 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PrameQ9D4Z5 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PrameQ9D4Z5 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PrameQ9D4Z5 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PrameQ9D4Z5 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PrameQ9D4Z5 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PrameQ9D4Z5 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PrameQ9D4Z5 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PrameQ9D4Z5 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PrameQ9D4Z5 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PrameQ9D4Z5 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PrameQ9D4Z5 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PrameQ9D4Z5 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PrameQ9D4Z5 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PrameQ9D4Z5 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PrameQ9D4Z5 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PrameQ9D4Z5 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PrameQ9D4Z5 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PrameQ9D4Z5 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PrameQ9D4Z5 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PrameQ9D4Z5 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PrameQ9D4Z5 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PrameQ9D4Z5 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PrameQ9D4Z5 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PrameQ9D4Z5 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PrameQ9D4Z5 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PrameQ9D4Z5 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PrameQ9D4Z5 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PrameQ9D4Z5 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PrameQ9D4Z5 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PrameQ9D4Z5 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PrameQ9D4Z5 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PrameQ9D4Z5 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PrameQ9D4Z5 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PrameQ9D4Z5 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PrameQ9D4Z5 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PrameQ9D4Z5 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PrameQ9D4Z5 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PrameQ9D4Z5 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PrameQ9D4Z5 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PrameQ9D4Z5 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PrameQ9D4Z5 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms