Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4S9

4931428L18Rik, RIKEN cDNA 4931428L18 gene, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4931428L18RikQ9D4S9 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
4931428L18RikQ9D4S9 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
4931428L18RikQ9D4S9 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
4931428L18RikQ9D4S9 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
4931428L18RikQ9D4S9 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
4931428L18RikQ9D4S9 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
4931428L18RikQ9D4S9 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
4931428L18RikQ9D4S9 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
4931428L18RikQ9D4S9 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
4931428L18RikQ9D4S9 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
4931428L18RikQ9D4S9 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
4931428L18RikQ9D4S9 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
4931428L18RikQ9D4S9 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
4931428L18RikQ9D4S9 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
4931428L18RikQ9D4S9 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
4931428L18RikQ9D4S9 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
4931428L18RikQ9D4S9 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
4931428L18RikQ9D4S9 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
4931428L18RikQ9D4S9 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
4931428L18RikQ9D4S9 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
4931428L18RikQ9D4S9 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
4931428L18RikQ9D4S9 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
4931428L18RikQ9D4S9 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
4931428L18RikQ9D4S9 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
4931428L18RikQ9D4S9 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
4931428L18RikQ9D4S9 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
4931428L18RikQ9D4S9 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
4931428L18RikQ9D4S9 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
4931428L18RikQ9D4S9 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
4931428L18RikQ9D4S9 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
4931428L18RikQ9D4S9 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
4931428L18RikQ9D4S9 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
4931428L18RikQ9D4S9 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
4931428L18RikQ9D4S9 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
4931428L18RikQ9D4S9 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
4931428L18RikQ9D4S9 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
4931428L18RikQ9D4S9 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
4931428L18RikQ9D4S9 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
4931428L18RikQ9D4S9 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
4931428L18RikQ9D4S9 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
4931428L18RikQ9D4S9 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
4931428L18RikQ9D4S9 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
4931428L18RikQ9D4S9 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
4931428L18RikQ9D4S9 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
4931428L18RikQ9D4S9 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
4931428L18RikQ9D4S9 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
4931428L18RikQ9D4S9 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
4931428L18RikQ9D4S9 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
4931428L18RikQ9D4S9 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
4931428L18RikQ9D4S9 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
4931428L18RikQ9D4S9 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
4931428L18RikQ9D4S9 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
4931428L18RikQ9D4S9 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
4931428L18RikQ9D4S9 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
4931428L18RikQ9D4S9 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
4931428L18RikQ9D4S9 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
4931428L18RikQ9D4S9 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
4931428L18RikQ9D4S9 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
4931428L18RikQ9D4S9 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
4931428L18RikQ9D4S9 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
4931428L18RikQ9D4S9 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
4931428L18RikQ9D4S9 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
4931428L18RikQ9D4S9 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
4931428L18RikQ9D4S9 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
4931428L18RikQ9D4S9 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
4931428L18RikQ9D4S9 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
4931428L18RikQ9D4S9 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
4931428L18RikQ9D4S9 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC13.84□□□□□ -0.19
4931428L18RikQ9D4S9 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
4931428L18RikQ9D4S9 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
4931428L18RikQ9D4S9 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
4931428L18RikQ9D4S9 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
4931428L18RikQ9D4S9 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
4931428L18RikQ9D4S9 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
4931428L18RikQ9D4S9 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
4931428L18RikQ9D4S9 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
4931428L18RikQ9D4S9 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
4931428L18RikQ9D4S9 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
4931428L18RikQ9D4S9 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
4931428L18RikQ9D4S9 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
4931428L18RikQ9D4S9 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
4931428L18RikQ9D4S9 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
4931428L18RikQ9D4S9 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
4931428L18RikQ9D4S9 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
4931428L18RikQ9D4S9 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
4931428L18RikQ9D4S9 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
4931428L18RikQ9D4S9 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
4931428L18RikQ9D4S9 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
4931428L18RikQ9D4S9 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
4931428L18RikQ9D4S9 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
4931428L18RikQ9D4S9 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
4931428L18RikQ9D4S9 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
4931428L18RikQ9D4S9 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
4931428L18RikQ9D4S9 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
4931428L18RikQ9D4S9 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
4931428L18RikQ9D4S9 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
4931428L18RikQ9D4S9 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
4931428L18RikQ9D4S9 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
4931428L18RikQ9D4S9 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
4931428L18RikQ9D4S9 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms