Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4J1

Efhd1, EF-hand domain-containing protein D1, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efhd1Q9D4J1 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Efhd1Q9D4J1 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Efhd1Q9D4J1 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Efhd1Q9D4J1 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Efhd1Q9D4J1 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Efhd1Q9D4J1 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Efhd1Q9D4J1 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Efhd1Q9D4J1 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Efhd1Q9D4J1 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Efhd1Q9D4J1 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Efhd1Q9D4J1 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Efhd1Q9D4J1 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Efhd1Q9D4J1 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Efhd1Q9D4J1 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Efhd1Q9D4J1 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Efhd1Q9D4J1 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Efhd1Q9D4J1 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Efhd1Q9D4J1 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Efhd1Q9D4J1 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Efhd1Q9D4J1 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Efhd1Q9D4J1 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Efhd1Q9D4J1 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Efhd1Q9D4J1 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Efhd1Q9D4J1 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Efhd1Q9D4J1 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Efhd1Q9D4J1 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Efhd1Q9D4J1 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Efhd1Q9D4J1 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Efhd1Q9D4J1 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Efhd1Q9D4J1 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Efhd1Q9D4J1 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Efhd1Q9D4J1 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Efhd1Q9D4J1 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Efhd1Q9D4J1 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Efhd1Q9D4J1 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Efhd1Q9D4J1 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Efhd1Q9D4J1 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Efhd1Q9D4J1 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Efhd1Q9D4J1 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Efhd1Q9D4J1 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Efhd1Q9D4J1 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Efhd1Q9D4J1 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Efhd1Q9D4J1 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Efhd1Q9D4J1 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Efhd1Q9D4J1 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Efhd1Q9D4J1 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Efhd1Q9D4J1 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Efhd1Q9D4J1 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Efhd1Q9D4J1 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Efhd1Q9D4J1 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Efhd1Q9D4J1 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Efhd1Q9D4J1 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Efhd1Q9D4J1 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Efhd1Q9D4J1 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Efhd1Q9D4J1 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Efhd1Q9D4J1 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Efhd1Q9D4J1 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Efhd1Q9D4J1 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Efhd1Q9D4J1 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Efhd1Q9D4J1 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Efhd1Q9D4J1 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Efhd1Q9D4J1 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Efhd1Q9D4J1 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Efhd1Q9D4J1 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Efhd1Q9D4J1 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Efhd1Q9D4J1 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Efhd1Q9D4J1 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Efhd1Q9D4J1 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Efhd1Q9D4J1 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Efhd1Q9D4J1 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Efhd1Q9D4J1 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Efhd1Q9D4J1 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Efhd1Q9D4J1 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Efhd1Q9D4J1 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Efhd1Q9D4J1 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Efhd1Q9D4J1 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Efhd1Q9D4J1 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Efhd1Q9D4J1 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Efhd1Q9D4J1 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Efhd1Q9D4J1 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Efhd1Q9D4J1 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Efhd1Q9D4J1 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Efhd1Q9D4J1 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Efhd1Q9D4J1 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Efhd1Q9D4J1 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Efhd1Q9D4J1 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Efhd1Q9D4J1 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Efhd1Q9D4J1 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Efhd1Q9D4J1 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Efhd1Q9D4J1 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Efhd1Q9D4J1 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Efhd1Q9D4J1 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Efhd1Q9D4J1 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Efhd1Q9D4J1 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Efhd1Q9D4J1 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Efhd1Q9D4J1 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Efhd1Q9D4J1 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Efhd1Q9D4J1 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Efhd1Q9D4J1 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Efhd1Q9D4J1 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms