Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4C9

Clvs1, Clavesin-1, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clvs1Q9D4C9 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clvs1Q9D4C9 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clvs1Q9D4C9 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clvs1Q9D4C9 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Clvs1Q9D4C9 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clvs1Q9D4C9 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clvs1Q9D4C9 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clvs1Q9D4C9 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clvs1Q9D4C9 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clvs1Q9D4C9 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clvs1Q9D4C9 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clvs1Q9D4C9 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clvs1Q9D4C9 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clvs1Q9D4C9 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clvs1Q9D4C9 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Clvs1Q9D4C9 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Clvs1Q9D4C9 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Clvs1Q9D4C9 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Clvs1Q9D4C9 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Clvs1Q9D4C9 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Clvs1Q9D4C9 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clvs1Q9D4C9 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clvs1Q9D4C9 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clvs1Q9D4C9 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clvs1Q9D4C9 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clvs1Q9D4C9 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clvs1Q9D4C9 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clvs1Q9D4C9 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clvs1Q9D4C9 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clvs1Q9D4C9 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clvs1Q9D4C9 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clvs1Q9D4C9 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clvs1Q9D4C9 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clvs1Q9D4C9 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clvs1Q9D4C9 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clvs1Q9D4C9 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clvs1Q9D4C9 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clvs1Q9D4C9 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clvs1Q9D4C9 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clvs1Q9D4C9 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clvs1Q9D4C9 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clvs1Q9D4C9 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clvs1Q9D4C9 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clvs1Q9D4C9 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clvs1Q9D4C9 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clvs1Q9D4C9 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clvs1Q9D4C9 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clvs1Q9D4C9 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clvs1Q9D4C9 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clvs1Q9D4C9 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clvs1Q9D4C9 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clvs1Q9D4C9 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clvs1Q9D4C9 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clvs1Q9D4C9 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clvs1Q9D4C9 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clvs1Q9D4C9 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clvs1Q9D4C9 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clvs1Q9D4C9 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clvs1Q9D4C9 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clvs1Q9D4C9 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clvs1Q9D4C9 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clvs1Q9D4C9 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clvs1Q9D4C9 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clvs1Q9D4C9 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clvs1Q9D4C9 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clvs1Q9D4C9 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clvs1Q9D4C9 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clvs1Q9D4C9 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clvs1Q9D4C9 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clvs1Q9D4C9 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clvs1Q9D4C9 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clvs1Q9D4C9 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Clvs1Q9D4C9 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clvs1Q9D4C9 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clvs1Q9D4C9 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clvs1Q9D4C9 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Clvs1Q9D4C9 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clvs1Q9D4C9 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clvs1Q9D4C9 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clvs1Q9D4C9 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clvs1Q9D4C9 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clvs1Q9D4C9 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clvs1Q9D4C9 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clvs1Q9D4C9 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clvs1Q9D4C9 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clvs1Q9D4C9 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clvs1Q9D4C9 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clvs1Q9D4C9 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clvs1Q9D4C9 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clvs1Q9D4C9 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clvs1Q9D4C9 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clvs1Q9D4C9 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clvs1Q9D4C9 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clvs1Q9D4C9 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clvs1Q9D4C9 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clvs1Q9D4C9 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clvs1Q9D4C9 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clvs1Q9D4C9 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clvs1Q9D4C9 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clvs1Q9D4C9 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms