Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3Z8

4933425L06Rik, RIKEN cDNA 4933425L06, mousemouse

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933425L06RikQ9D3Z8 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
4933425L06RikQ9D3Z8 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4933425L06RikQ9D3Z8 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4933425L06RikQ9D3Z8 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4933425L06RikQ9D3Z8 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4933425L06RikQ9D3Z8 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4933425L06RikQ9D3Z8 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
4933425L06RikQ9D3Z8 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
4933425L06RikQ9D3Z8 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
4933425L06RikQ9D3Z8 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4933425L06RikQ9D3Z8 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4933425L06RikQ9D3Z8 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4933425L06RikQ9D3Z8 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
4933425L06RikQ9D3Z8 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4933425L06RikQ9D3Z8 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4933425L06RikQ9D3Z8 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4933425L06RikQ9D3Z8 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4933425L06RikQ9D3Z8 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
4933425L06RikQ9D3Z8 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4933425L06RikQ9D3Z8 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4933425L06RikQ9D3Z8 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4933425L06RikQ9D3Z8 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4933425L06RikQ9D3Z8 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4933425L06RikQ9D3Z8 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
4933425L06RikQ9D3Z8 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
4933425L06RikQ9D3Z8 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
4933425L06RikQ9D3Z8 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
4933425L06RikQ9D3Z8 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
4933425L06RikQ9D3Z8 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
4933425L06RikQ9D3Z8 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
4933425L06RikQ9D3Z8 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
4933425L06RikQ9D3Z8 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
4933425L06RikQ9D3Z8 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
4933425L06RikQ9D3Z8 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
4933425L06RikQ9D3Z8 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
4933425L06RikQ9D3Z8 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
4933425L06RikQ9D3Z8 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
4933425L06RikQ9D3Z8 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
4933425L06RikQ9D3Z8 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
4933425L06RikQ9D3Z8 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
4933425L06RikQ9D3Z8 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
4933425L06RikQ9D3Z8 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
4933425L06RikQ9D3Z8 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
4933425L06RikQ9D3Z8 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
4933425L06RikQ9D3Z8 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
4933425L06RikQ9D3Z8 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
4933425L06RikQ9D3Z8 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
4933425L06RikQ9D3Z8 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
4933425L06RikQ9D3Z8 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
4933425L06RikQ9D3Z8 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
4933425L06RikQ9D3Z8 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
4933425L06RikQ9D3Z8 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
4933425L06RikQ9D3Z8 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
4933425L06RikQ9D3Z8 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
4933425L06RikQ9D3Z8 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
4933425L06RikQ9D3Z8 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
4933425L06RikQ9D3Z8 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
4933425L06RikQ9D3Z8 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
4933425L06RikQ9D3Z8 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
4933425L06RikQ9D3Z8 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
4933425L06RikQ9D3Z8 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
4933425L06RikQ9D3Z8 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
4933425L06RikQ9D3Z8 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
4933425L06RikQ9D3Z8 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
4933425L06RikQ9D3Z8 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
4933425L06RikQ9D3Z8 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
4933425L06RikQ9D3Z8 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
4933425L06RikQ9D3Z8 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
4933425L06RikQ9D3Z8 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
4933425L06RikQ9D3Z8 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
4933425L06RikQ9D3Z8 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
4933425L06RikQ9D3Z8 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
4933425L06RikQ9D3Z8 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
4933425L06RikQ9D3Z8 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
4933425L06RikQ9D3Z8 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
4933425L06RikQ9D3Z8 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
4933425L06RikQ9D3Z8 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
4933425L06RikQ9D3Z8 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
4933425L06RikQ9D3Z8 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
4933425L06RikQ9D3Z8 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
4933425L06RikQ9D3Z8 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
4933425L06RikQ9D3Z8 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
4933425L06RikQ9D3Z8 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
4933425L06RikQ9D3Z8 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
4933425L06RikQ9D3Z8 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
4933425L06RikQ9D3Z8 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
4933425L06RikQ9D3Z8 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
4933425L06RikQ9D3Z8 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
4933425L06RikQ9D3Z8 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
4933425L06RikQ9D3Z8 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
4933425L06RikQ9D3Z8 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
4933425L06RikQ9D3Z8 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
4933425L06RikQ9D3Z8 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
4933425L06RikQ9D3Z8 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
4933425L06RikQ9D3Z8 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
4933425L06RikQ9D3Z8 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms