Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3T1

4933436I01Rik, RIKEN cDNA 4933436I01, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933436I01RikQ9D3T1 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4933436I01RikQ9D3T1 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4933436I01RikQ9D3T1 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
4933436I01RikQ9D3T1 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4933436I01RikQ9D3T1 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
4933436I01RikQ9D3T1 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
4933436I01RikQ9D3T1 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
4933436I01RikQ9D3T1 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
4933436I01RikQ9D3T1 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
4933436I01RikQ9D3T1 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
4933436I01RikQ9D3T1 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
4933436I01RikQ9D3T1 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
4933436I01RikQ9D3T1 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
4933436I01RikQ9D3T1 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
4933436I01RikQ9D3T1 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
4933436I01RikQ9D3T1 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
4933436I01RikQ9D3T1 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
4933436I01RikQ9D3T1 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
4933436I01RikQ9D3T1 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
4933436I01RikQ9D3T1 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
4933436I01RikQ9D3T1 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
4933436I01RikQ9D3T1 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
4933436I01RikQ9D3T1 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
4933436I01RikQ9D3T1 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
4933436I01RikQ9D3T1 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
4933436I01RikQ9D3T1 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
4933436I01RikQ9D3T1 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
4933436I01RikQ9D3T1 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
4933436I01RikQ9D3T1 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
4933436I01RikQ9D3T1 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
4933436I01RikQ9D3T1 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
4933436I01RikQ9D3T1 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
4933436I01RikQ9D3T1 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
4933436I01RikQ9D3T1 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
4933436I01RikQ9D3T1 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
4933436I01RikQ9D3T1 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
4933436I01RikQ9D3T1 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
4933436I01RikQ9D3T1 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
4933436I01RikQ9D3T1 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
4933436I01RikQ9D3T1 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
4933436I01RikQ9D3T1 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
4933436I01RikQ9D3T1 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
4933436I01RikQ9D3T1 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
4933436I01RikQ9D3T1 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
4933436I01RikQ9D3T1 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
4933436I01RikQ9D3T1 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
4933436I01RikQ9D3T1 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
4933436I01RikQ9D3T1 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
4933436I01RikQ9D3T1 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
4933436I01RikQ9D3T1 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
4933436I01RikQ9D3T1 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
4933436I01RikQ9D3T1 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
4933436I01RikQ9D3T1 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
4933436I01RikQ9D3T1 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
4933436I01RikQ9D3T1 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
4933436I01RikQ9D3T1 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
4933436I01RikQ9D3T1 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
4933436I01RikQ9D3T1 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
4933436I01RikQ9D3T1 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
4933436I01RikQ9D3T1 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
4933436I01RikQ9D3T1 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
4933436I01RikQ9D3T1 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
4933436I01RikQ9D3T1 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
4933436I01RikQ9D3T1 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
4933436I01RikQ9D3T1 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4933436I01RikQ9D3T1 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
4933436I01RikQ9D3T1 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4933436I01RikQ9D3T1 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4933436I01RikQ9D3T1 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4933436I01RikQ9D3T1 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
4933436I01RikQ9D3T1 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4933436I01RikQ9D3T1 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4933436I01RikQ9D3T1 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4933436I01RikQ9D3T1 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4933436I01RikQ9D3T1 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
4933436I01RikQ9D3T1 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4933436I01RikQ9D3T1 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4933436I01RikQ9D3T1 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4933436I01RikQ9D3T1 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
4933436I01RikQ9D3T1 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4933436I01RikQ9D3T1 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
4933436I01RikQ9D3T1 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4933436I01RikQ9D3T1 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4933436I01RikQ9D3T1 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4933436I01RikQ9D3T1 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
4933436I01RikQ9D3T1 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4933436I01RikQ9D3T1 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4933436I01RikQ9D3T1 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4933436I01RikQ9D3T1 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
4933436I01RikQ9D3T1 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
4933436I01RikQ9D3T1 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4933436I01RikQ9D3T1 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4933436I01RikQ9D3T1 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4933436I01RikQ9D3T1 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
4933436I01RikQ9D3T1 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4933436I01RikQ9D3T1 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4933436I01RikQ9D3T1 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4933436I01RikQ9D3T1 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4933436I01RikQ9D3T1 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
4933436I01RikQ9D3T1 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms