Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3B1

Hacd2, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 2, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hacd2Q9D3B1 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hacd2Q9D3B1 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hacd2Q9D3B1 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hacd2Q9D3B1 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hacd2Q9D3B1 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hacd2Q9D3B1 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hacd2Q9D3B1 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hacd2Q9D3B1 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hacd2Q9D3B1 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hacd2Q9D3B1 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hacd2Q9D3B1 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hacd2Q9D3B1 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hacd2Q9D3B1 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hacd2Q9D3B1 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hacd2Q9D3B1 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hacd2Q9D3B1 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hacd2Q9D3B1 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hacd2Q9D3B1 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hacd2Q9D3B1 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hacd2Q9D3B1 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Hacd2Q9D3B1 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hacd2Q9D3B1 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hacd2Q9D3B1 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hacd2Q9D3B1 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hacd2Q9D3B1 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hacd2Q9D3B1 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hacd2Q9D3B1 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hacd2Q9D3B1 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hacd2Q9D3B1 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hacd2Q9D3B1 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hacd2Q9D3B1 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Hacd2Q9D3B1 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Hacd2Q9D3B1 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hacd2Q9D3B1 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hacd2Q9D3B1 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hacd2Q9D3B1 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hacd2Q9D3B1 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hacd2Q9D3B1 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hacd2Q9D3B1 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hacd2Q9D3B1 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hacd2Q9D3B1 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Hacd2Q9D3B1 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Hacd2Q9D3B1 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hacd2Q9D3B1 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hacd2Q9D3B1 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hacd2Q9D3B1 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hacd2Q9D3B1 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hacd2Q9D3B1 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hacd2Q9D3B1 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hacd2Q9D3B1 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hacd2Q9D3B1 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hacd2Q9D3B1 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hacd2Q9D3B1 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hacd2Q9D3B1 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hacd2Q9D3B1 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hacd2Q9D3B1 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hacd2Q9D3B1 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hacd2Q9D3B1 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hacd2Q9D3B1 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Hacd2Q9D3B1 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hacd2Q9D3B1 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hacd2Q9D3B1 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hacd2Q9D3B1 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hacd2Q9D3B1 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hacd2Q9D3B1 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hacd2Q9D3B1 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hacd2Q9D3B1 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hacd2Q9D3B1 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hacd2Q9D3B1 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hacd2Q9D3B1 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hacd2Q9D3B1 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hacd2Q9D3B1 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Hacd2Q9D3B1 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hacd2Q9D3B1 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Hacd2Q9D3B1 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Hacd2Q9D3B1 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Hacd2Q9D3B1 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hacd2Q9D3B1 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hacd2Q9D3B1 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hacd2Q9D3B1 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hacd2Q9D3B1 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hacd2Q9D3B1 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hacd2Q9D3B1 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hacd2Q9D3B1 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hacd2Q9D3B1 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hacd2Q9D3B1 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hacd2Q9D3B1 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hacd2Q9D3B1 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hacd2Q9D3B1 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hacd2Q9D3B1 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hacd2Q9D3B1 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hacd2Q9D3B1 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hacd2Q9D3B1 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hacd2Q9D3B1 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hacd2Q9D3B1 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hacd2Q9D3B1 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hacd2Q9D3B1 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hacd2Q9D3B1 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hacd2Q9D3B1 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hacd2Q9D3B1 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms