Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2R4

Tmed11, Transmembrane emp24 domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed11Q9D2R4 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmed11Q9D2R4 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmed11Q9D2R4 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmed11Q9D2R4 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmed11Q9D2R4 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmed11Q9D2R4 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmed11Q9D2R4 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmed11Q9D2R4 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmed11Q9D2R4 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmed11Q9D2R4 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmed11Q9D2R4 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmed11Q9D2R4 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmed11Q9D2R4 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmed11Q9D2R4 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmed11Q9D2R4 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmed11Q9D2R4 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmed11Q9D2R4 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmed11Q9D2R4 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmed11Q9D2R4 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmed11Q9D2R4 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmed11Q9D2R4 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmed11Q9D2R4 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmed11Q9D2R4 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmed11Q9D2R4 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmed11Q9D2R4 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmed11Q9D2R4 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmed11Q9D2R4 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmed11Q9D2R4 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmed11Q9D2R4 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmed11Q9D2R4 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmed11Q9D2R4 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmed11Q9D2R4 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmed11Q9D2R4 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmed11Q9D2R4 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmed11Q9D2R4 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmed11Q9D2R4 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmed11Q9D2R4 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmed11Q9D2R4 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmed11Q9D2R4 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmed11Q9D2R4 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmed11Q9D2R4 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmed11Q9D2R4 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmed11Q9D2R4 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmed11Q9D2R4 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmed11Q9D2R4 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmed11Q9D2R4 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmed11Q9D2R4 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmed11Q9D2R4 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Tmed11Q9D2R4 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmed11Q9D2R4 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmed11Q9D2R4 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmed11Q9D2R4 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmed11Q9D2R4 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmed11Q9D2R4 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmed11Q9D2R4 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmed11Q9D2R4 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tmed11Q9D2R4 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tmed11Q9D2R4 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tmed11Q9D2R4 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmed11Q9D2R4 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmed11Q9D2R4 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
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Tmed11Q9D2R4 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmed11Q9D2R4 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmed11Q9D2R4 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmed11Q9D2R4 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmed11Q9D2R4 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmed11Q9D2R4 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmed11Q9D2R4 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmed11Q9D2R4 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmed11Q9D2R4 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmed11Q9D2R4 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmed11Q9D2R4 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmed11Q9D2R4 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmed11Q9D2R4 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmed11Q9D2R4 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmed11Q9D2R4 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmed11Q9D2R4 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmed11Q9D2R4 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmed11Q9D2R4 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmed11Q9D2R4 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmed11Q9D2R4 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmed11Q9D2R4 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmed11Q9D2R4 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmed11Q9D2R4 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmed11Q9D2R4 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmed11Q9D2R4 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmed11Q9D2R4 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmed11Q9D2R4 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmed11Q9D2R4 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmed11Q9D2R4 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmed11Q9D2R4 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
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Tmed11Q9D2R4 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
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Tmed11Q9D2R4 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmed11Q9D2R4 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
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