Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1B9

Mrpl28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, mousemouse

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Length 257 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl28Q9D1B9 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mrpl28Q9D1B9 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mrpl28Q9D1B9 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mrpl28Q9D1B9 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mrpl28Q9D1B9 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mrpl28Q9D1B9 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mrpl28Q9D1B9 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mrpl28Q9D1B9 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mrpl28Q9D1B9 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mrpl28Q9D1B9 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mrpl28Q9D1B9 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mrpl28Q9D1B9 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Mrpl28Q9D1B9 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mrpl28Q9D1B9 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mrpl28Q9D1B9 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mrpl28Q9D1B9 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mrpl28Q9D1B9 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mrpl28Q9D1B9 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mrpl28Q9D1B9 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mrpl28Q9D1B9 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Mrpl28Q9D1B9 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mrpl28Q9D1B9 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mrpl28Q9D1B9 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mrpl28Q9D1B9 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mrpl28Q9D1B9 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mrpl28Q9D1B9 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Mrpl28Q9D1B9 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mrpl28Q9D1B9 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mrpl28Q9D1B9 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mrpl28Q9D1B9 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mrpl28Q9D1B9 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mrpl28Q9D1B9 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Mrpl28Q9D1B9 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mrpl28Q9D1B9 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mrpl28Q9D1B9 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mrpl28Q9D1B9 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mrpl28Q9D1B9 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mrpl28Q9D1B9 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mrpl28Q9D1B9 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mrpl28Q9D1B9 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mrpl28Q9D1B9 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mrpl28Q9D1B9 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mrpl28Q9D1B9 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mrpl28Q9D1B9 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mrpl28Q9D1B9 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mrpl28Q9D1B9 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mrpl28Q9D1B9 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mrpl28Q9D1B9 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mrpl28Q9D1B9 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mrpl28Q9D1B9 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mrpl28Q9D1B9 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mrpl28Q9D1B9 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mrpl28Q9D1B9 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mrpl28Q9D1B9 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mrpl28Q9D1B9 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mrpl28Q9D1B9 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mrpl28Q9D1B9 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mrpl28Q9D1B9 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mrpl28Q9D1B9 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mrpl28Q9D1B9 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mrpl28Q9D1B9 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mrpl28Q9D1B9 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mrpl28Q9D1B9 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mrpl28Q9D1B9 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
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Mrpl28Q9D1B9 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mrpl28Q9D1B9 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
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Mrpl28Q9D1B9 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mrpl28Q9D1B9 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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Mrpl28Q9D1B9 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mrpl28Q9D1B9 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mrpl28Q9D1B9 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mrpl28Q9D1B9 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mrpl28Q9D1B9 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mrpl28Q9D1B9 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mrpl28Q9D1B9 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mrpl28Q9D1B9 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mrpl28Q9D1B9 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mrpl28Q9D1B9 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mrpl28Q9D1B9 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mrpl28Q9D1B9 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mrpl28Q9D1B9 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mrpl28Q9D1B9 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mrpl28Q9D1B9 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mrpl28Q9D1B9 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mrpl28Q9D1B9 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mrpl28Q9D1B9 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mrpl28Q9D1B9 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mrpl28Q9D1B9 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mrpl28Q9D1B9 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mrpl28Q9D1B9 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mrpl28Q9D1B9 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mrpl28Q9D1B9 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mrpl28Q9D1B9 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Mrpl28Q9D1B9 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mrpl28Q9D1B9 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mrpl28Q9D1B9 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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