Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0R8

Lsm12, Protein LSM12 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm12Q9D0R8 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lsm12Q9D0R8 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lsm12Q9D0R8 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lsm12Q9D0R8 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lsm12Q9D0R8 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lsm12Q9D0R8 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lsm12Q9D0R8 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lsm12Q9D0R8 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lsm12Q9D0R8 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lsm12Q9D0R8 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lsm12Q9D0R8 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lsm12Q9D0R8 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lsm12Q9D0R8 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lsm12Q9D0R8 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lsm12Q9D0R8 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lsm12Q9D0R8 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lsm12Q9D0R8 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Lsm12Q9D0R8 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lsm12Q9D0R8 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lsm12Q9D0R8 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lsm12Q9D0R8 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lsm12Q9D0R8 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lsm12Q9D0R8 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lsm12Q9D0R8 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lsm12Q9D0R8 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lsm12Q9D0R8 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lsm12Q9D0R8 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lsm12Q9D0R8 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lsm12Q9D0R8 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lsm12Q9D0R8 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lsm12Q9D0R8 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lsm12Q9D0R8 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lsm12Q9D0R8 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lsm12Q9D0R8 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lsm12Q9D0R8 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lsm12Q9D0R8 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Lsm12Q9D0R8 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Lsm12Q9D0R8 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lsm12Q9D0R8 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lsm12Q9D0R8 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lsm12Q9D0R8 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lsm12Q9D0R8 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lsm12Q9D0R8 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lsm12Q9D0R8 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lsm12Q9D0R8 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lsm12Q9D0R8 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lsm12Q9D0R8 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lsm12Q9D0R8 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lsm12Q9D0R8 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lsm12Q9D0R8 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lsm12Q9D0R8 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lsm12Q9D0R8 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lsm12Q9D0R8 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lsm12Q9D0R8 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lsm12Q9D0R8 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lsm12Q9D0R8 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lsm12Q9D0R8 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lsm12Q9D0R8 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lsm12Q9D0R8 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lsm12Q9D0R8 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lsm12Q9D0R8 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lsm12Q9D0R8 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lsm12Q9D0R8 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Lsm12Q9D0R8 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lsm12Q9D0R8 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lsm12Q9D0R8 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lsm12Q9D0R8 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lsm12Q9D0R8 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lsm12Q9D0R8 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lsm12Q9D0R8 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lsm12Q9D0R8 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lsm12Q9D0R8 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lsm12Q9D0R8 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lsm12Q9D0R8 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Lsm12Q9D0R8 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Lsm12Q9D0R8 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Lsm12Q9D0R8 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Lsm12Q9D0R8 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Lsm12Q9D0R8 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lsm12Q9D0R8 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lsm12Q9D0R8 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lsm12Q9D0R8 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lsm12Q9D0R8 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lsm12Q9D0R8 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Lsm12Q9D0R8 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lsm12Q9D0R8 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lsm12Q9D0R8 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lsm12Q9D0R8 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lsm12Q9D0R8 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lsm12Q9D0R8 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lsm12Q9D0R8 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lsm12Q9D0R8 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lsm12Q9D0R8 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lsm12Q9D0R8 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lsm12Q9D0R8 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lsm12Q9D0R8 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lsm12Q9D0R8 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lsm12Q9D0R8 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lsm12Q9D0R8 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lsm12Q9D0R8 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms