Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc47Q9D024 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc47Q9D024 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc47Q9D024 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc47Q9D024 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc47Q9D024 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc47Q9D024 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc47Q9D024 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc47Q9D024 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc47Q9D024 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc47Q9D024 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc47Q9D024 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc47Q9D024 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc47Q9D024 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc47Q9D024 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc47Q9D024 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc47Q9D024 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc47Q9D024 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc47Q9D024 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc47Q9D024 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc47Q9D024 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc47Q9D024 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc47Q9D024 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc47Q9D024 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc47Q9D024 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc47Q9D024 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc47Q9D024 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc47Q9D024 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc47Q9D024 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc47Q9D024 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc47Q9D024 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc47Q9D024 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc47Q9D024 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc47Q9D024 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc47Q9D024 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc47Q9D024 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc47Q9D024 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc47Q9D024 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc47Q9D024 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc47Q9D024 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc47Q9D024 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc47Q9D024 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc47Q9D024 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc47Q9D024 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc47Q9D024 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc47Q9D024 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc47Q9D024 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc47Q9D024 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc47Q9D024 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc47Q9D024 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc47Q9D024 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc47Q9D024 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc47Q9D024 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc47Q9D024 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc47Q9D024 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc47Q9D024 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc47Q9D024 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc47Q9D024 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc47Q9D024 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc47Q9D024 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc47Q9D024 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc47Q9D024 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc47Q9D024 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc47Q9D024 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc47Q9D024 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc47Q9D024 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc47Q9D024 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc47Q9D024 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc47Q9D024 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc47Q9D024 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc47Q9D024 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc47Q9D024 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc47Q9D024 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc47Q9D024 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc47Q9D024 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc47Q9D024 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc47Q9D024 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc47Q9D024 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc47Q9D024 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc47Q9D024 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc47Q9D024 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc47Q9D024 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ccdc47Q9D024 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ccdc47Q9D024 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ccdc47Q9D024 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ccdc47Q9D024 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ccdc47Q9D024 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ccdc47Q9D024 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ccdc47Q9D024 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ccdc47Q9D024 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ccdc47Q9D024 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ccdc47Q9D024 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc47Q9D024 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc47Q9D024 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc47Q9D024 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc47Q9D024 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc47Q9D024 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc47Q9D024 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc47Q9D024 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc47Q9D024 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
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