Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZW4

Acsl3, Long-chain-fatty-acid--CoA ligase 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 720 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acsl3Q9CZW4 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Acsl3Q9CZW4 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Acsl3Q9CZW4 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Acsl3Q9CZW4 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Acsl3Q9CZW4 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Acsl3Q9CZW4 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Acsl3Q9CZW4 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Acsl3Q9CZW4 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Acsl3Q9CZW4 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Acsl3Q9CZW4 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Acsl3Q9CZW4 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Acsl3Q9CZW4 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Acsl3Q9CZW4 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Acsl3Q9CZW4 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Acsl3Q9CZW4 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Acsl3Q9CZW4 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Acsl3Q9CZW4 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Acsl3Q9CZW4 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Acsl3Q9CZW4 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Acsl3Q9CZW4 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Acsl3Q9CZW4 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Acsl3Q9CZW4 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Acsl3Q9CZW4 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Acsl3Q9CZW4 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Acsl3Q9CZW4 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Acsl3Q9CZW4 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Acsl3Q9CZW4 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Acsl3Q9CZW4 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Acsl3Q9CZW4 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Acsl3Q9CZW4 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Acsl3Q9CZW4 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Acsl3Q9CZW4 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Acsl3Q9CZW4 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Acsl3Q9CZW4 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Acsl3Q9CZW4 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Acsl3Q9CZW4 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Acsl3Q9CZW4 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Acsl3Q9CZW4 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Acsl3Q9CZW4 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Acsl3Q9CZW4 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Acsl3Q9CZW4 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Acsl3Q9CZW4 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Acsl3Q9CZW4 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Acsl3Q9CZW4 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Acsl3Q9CZW4 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Acsl3Q9CZW4 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Acsl3Q9CZW4 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Acsl3Q9CZW4 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Acsl3Q9CZW4 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Acsl3Q9CZW4 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Acsl3Q9CZW4 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Acsl3Q9CZW4 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Acsl3Q9CZW4 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Acsl3Q9CZW4 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Acsl3Q9CZW4 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Acsl3Q9CZW4 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Acsl3Q9CZW4 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Acsl3Q9CZW4 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Acsl3Q9CZW4 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Acsl3Q9CZW4 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Acsl3Q9CZW4 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Acsl3Q9CZW4 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Acsl3Q9CZW4 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Acsl3Q9CZW4 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Acsl3Q9CZW4 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Acsl3Q9CZW4 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Acsl3Q9CZW4 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Acsl3Q9CZW4 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Acsl3Q9CZW4 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Acsl3Q9CZW4 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Acsl3Q9CZW4 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Acsl3Q9CZW4 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Acsl3Q9CZW4 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Acsl3Q9CZW4 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Acsl3Q9CZW4 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Acsl3Q9CZW4 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Acsl3Q9CZW4 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Acsl3Q9CZW4 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Acsl3Q9CZW4 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Acsl3Q9CZW4 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Acsl3Q9CZW4 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Acsl3Q9CZW4 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Acsl3Q9CZW4 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Acsl3Q9CZW4 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Acsl3Q9CZW4 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Acsl3Q9CZW4 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Acsl3Q9CZW4 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Acsl3Q9CZW4 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Acsl3Q9CZW4 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Acsl3Q9CZW4 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Acsl3Q9CZW4 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Acsl3Q9CZW4 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Acsl3Q9CZW4 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Acsl3Q9CZW4 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Acsl3Q9CZW4 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Acsl3Q9CZW4 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Acsl3Q9CZW4 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Acsl3Q9CZW4 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Acsl3Q9CZW4 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Acsl3Q9CZW4 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms