Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZN4

Shisa9, Protein shisa-9, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisa9Q9CZN4 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Shisa9Q9CZN4 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Shisa9Q9CZN4 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Shisa9Q9CZN4 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Shisa9Q9CZN4 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Shisa9Q9CZN4 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Shisa9Q9CZN4 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Shisa9Q9CZN4 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Shisa9Q9CZN4 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Shisa9Q9CZN4 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Shisa9Q9CZN4 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Shisa9Q9CZN4 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Shisa9Q9CZN4 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Shisa9Q9CZN4 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Shisa9Q9CZN4 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Shisa9Q9CZN4 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Shisa9Q9CZN4 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Shisa9Q9CZN4 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Shisa9Q9CZN4 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Shisa9Q9CZN4 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Shisa9Q9CZN4 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Shisa9Q9CZN4 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Shisa9Q9CZN4 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Shisa9Q9CZN4 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Shisa9Q9CZN4 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Shisa9Q9CZN4 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Shisa9Q9CZN4 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Shisa9Q9CZN4 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Shisa9Q9CZN4 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Shisa9Q9CZN4 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Shisa9Q9CZN4 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Shisa9Q9CZN4 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Shisa9Q9CZN4 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Shisa9Q9CZN4 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Shisa9Q9CZN4 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Shisa9Q9CZN4 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Shisa9Q9CZN4 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Shisa9Q9CZN4 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Shisa9Q9CZN4 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Shisa9Q9CZN4 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Shisa9Q9CZN4 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Shisa9Q9CZN4 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Shisa9Q9CZN4 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Shisa9Q9CZN4 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Shisa9Q9CZN4 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Shisa9Q9CZN4 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Shisa9Q9CZN4 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Shisa9Q9CZN4 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Shisa9Q9CZN4 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Shisa9Q9CZN4 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Shisa9Q9CZN4 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Shisa9Q9CZN4 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Shisa9Q9CZN4 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Shisa9Q9CZN4 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Shisa9Q9CZN4 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Shisa9Q9CZN4 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Shisa9Q9CZN4 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Shisa9Q9CZN4 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Shisa9Q9CZN4 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Shisa9Q9CZN4 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Shisa9Q9CZN4 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Shisa9Q9CZN4 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Shisa9Q9CZN4 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Shisa9Q9CZN4 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Shisa9Q9CZN4 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Shisa9Q9CZN4 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Shisa9Q9CZN4 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Shisa9Q9CZN4 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Shisa9Q9CZN4 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Shisa9Q9CZN4 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Shisa9Q9CZN4 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Shisa9Q9CZN4 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Shisa9Q9CZN4 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Shisa9Q9CZN4 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Shisa9Q9CZN4 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Shisa9Q9CZN4 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Shisa9Q9CZN4 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Shisa9Q9CZN4 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Shisa9Q9CZN4 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Shisa9Q9CZN4 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Shisa9Q9CZN4 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Shisa9Q9CZN4 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Shisa9Q9CZN4 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Shisa9Q9CZN4 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Shisa9Q9CZN4 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Shisa9Q9CZN4 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Shisa9Q9CZN4 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Shisa9Q9CZN4 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Shisa9Q9CZN4 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Shisa9Q9CZN4 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Shisa9Q9CZN4 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Shisa9Q9CZN4 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Shisa9Q9CZN4 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Shisa9Q9CZN4 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Shisa9Q9CZN4 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Shisa9Q9CZN4 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Shisa9Q9CZN4 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Shisa9Q9CZN4 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Shisa9Q9CZN4 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Shisa9Q9CZN4 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms