Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZA6

Nde1, Nuclear distribution protein nudE homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nde1Q9CZA6 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nde1Q9CZA6 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nde1Q9CZA6 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nde1Q9CZA6 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nde1Q9CZA6 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nde1Q9CZA6 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nde1Q9CZA6 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nde1Q9CZA6 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Nde1Q9CZA6 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nde1Q9CZA6 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nde1Q9CZA6 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nde1Q9CZA6 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nde1Q9CZA6 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nde1Q9CZA6 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nde1Q9CZA6 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nde1Q9CZA6 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nde1Q9CZA6 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Nde1Q9CZA6 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nde1Q9CZA6 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nde1Q9CZA6 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nde1Q9CZA6 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nde1Q9CZA6 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nde1Q9CZA6 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nde1Q9CZA6 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nde1Q9CZA6 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nde1Q9CZA6 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nde1Q9CZA6 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nde1Q9CZA6 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nde1Q9CZA6 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nde1Q9CZA6 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nde1Q9CZA6 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nde1Q9CZA6 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nde1Q9CZA6 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nde1Q9CZA6 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nde1Q9CZA6 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nde1Q9CZA6 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Nde1Q9CZA6 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Nde1Q9CZA6 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Nde1Q9CZA6 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nde1Q9CZA6 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Nde1Q9CZA6 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Nde1Q9CZA6 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nde1Q9CZA6 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Nde1Q9CZA6 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Nde1Q9CZA6 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nde1Q9CZA6 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nde1Q9CZA6 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nde1Q9CZA6 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nde1Q9CZA6 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nde1Q9CZA6 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nde1Q9CZA6 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nde1Q9CZA6 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nde1Q9CZA6 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nde1Q9CZA6 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nde1Q9CZA6 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nde1Q9CZA6 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nde1Q9CZA6 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nde1Q9CZA6 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nde1Q9CZA6 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nde1Q9CZA6 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nde1Q9CZA6 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nde1Q9CZA6 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nde1Q9CZA6 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nde1Q9CZA6 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nde1Q9CZA6 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nde1Q9CZA6 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nde1Q9CZA6 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nde1Q9CZA6 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nde1Q9CZA6 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nde1Q9CZA6 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nde1Q9CZA6 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nde1Q9CZA6 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nde1Q9CZA6 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nde1Q9CZA6 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nde1Q9CZA6 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nde1Q9CZA6 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nde1Q9CZA6 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nde1Q9CZA6 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nde1Q9CZA6 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nde1Q9CZA6 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nde1Q9CZA6 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nde1Q9CZA6 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nde1Q9CZA6 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nde1Q9CZA6 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nde1Q9CZA6 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nde1Q9CZA6 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nde1Q9CZA6 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nde1Q9CZA6 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nde1Q9CZA6 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nde1Q9CZA6 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nde1Q9CZA6 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nde1Q9CZA6 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nde1Q9CZA6 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nde1Q9CZA6 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Nde1Q9CZA6 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nde1Q9CZA6 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nde1Q9CZA6 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nde1Q9CZA6 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nde1Q9CZA6 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nde1Q9CZA6 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.3 ms