Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ49

Klhl35, Kelch-like protein 35, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl35Q9CZ49 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Klhl35Q9CZ49 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Klhl35Q9CZ49 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Klhl35Q9CZ49 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Klhl35Q9CZ49 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Klhl35Q9CZ49 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Klhl35Q9CZ49 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Klhl35Q9CZ49 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Klhl35Q9CZ49 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Klhl35Q9CZ49 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Klhl35Q9CZ49 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Klhl35Q9CZ49 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Klhl35Q9CZ49 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Klhl35Q9CZ49 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Klhl35Q9CZ49 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Klhl35Q9CZ49 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Klhl35Q9CZ49 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Klhl35Q9CZ49 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Klhl35Q9CZ49 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Klhl35Q9CZ49 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Klhl35Q9CZ49 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Klhl35Q9CZ49 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Klhl35Q9CZ49 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Klhl35Q9CZ49 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Klhl35Q9CZ49 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Klhl35Q9CZ49 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Klhl35Q9CZ49 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Klhl35Q9CZ49 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Klhl35Q9CZ49 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Klhl35Q9CZ49 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Klhl35Q9CZ49 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Klhl35Q9CZ49 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Klhl35Q9CZ49 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Klhl35Q9CZ49 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Klhl35Q9CZ49 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Klhl35Q9CZ49 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Klhl35Q9CZ49 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Klhl35Q9CZ49 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Klhl35Q9CZ49 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Klhl35Q9CZ49 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Klhl35Q9CZ49 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Klhl35Q9CZ49 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Klhl35Q9CZ49 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Klhl35Q9CZ49 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Klhl35Q9CZ49 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Klhl35Q9CZ49 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Klhl35Q9CZ49 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Klhl35Q9CZ49 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Klhl35Q9CZ49 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Klhl35Q9CZ49 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Klhl35Q9CZ49 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Klhl35Q9CZ49 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Klhl35Q9CZ49 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Klhl35Q9CZ49 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Klhl35Q9CZ49 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Klhl35Q9CZ49 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Klhl35Q9CZ49 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Klhl35Q9CZ49 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Klhl35Q9CZ49 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Klhl35Q9CZ49 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Klhl35Q9CZ49 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Klhl35Q9CZ49 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Klhl35Q9CZ49 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Klhl35Q9CZ49 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Klhl35Q9CZ49 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Klhl35Q9CZ49 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Klhl35Q9CZ49 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Klhl35Q9CZ49 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Klhl35Q9CZ49 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Klhl35Q9CZ49 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Klhl35Q9CZ49 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Klhl35Q9CZ49 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Klhl35Q9CZ49 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Klhl35Q9CZ49 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Klhl35Q9CZ49 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Klhl35Q9CZ49 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Klhl35Q9CZ49 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Klhl35Q9CZ49 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Klhl35Q9CZ49 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Klhl35Q9CZ49 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Klhl35Q9CZ49 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Klhl35Q9CZ49 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Klhl35Q9CZ49 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Klhl35Q9CZ49 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Klhl35Q9CZ49 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Klhl35Q9CZ49 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Klhl35Q9CZ49 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Klhl35Q9CZ49 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Klhl35Q9CZ49 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Klhl35Q9CZ49 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Klhl35Q9CZ49 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Klhl35Q9CZ49 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Klhl35Q9CZ49 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Klhl35Q9CZ49 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Klhl35Q9CZ49 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Klhl35Q9CZ49 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Klhl35Q9CZ49 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Klhl35Q9CZ49 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Klhl35Q9CZ49 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Klhl35Q9CZ49 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms