Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ44

Nsfl1c, NSFL1 cofactor p47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsfl1cQ9CZ44 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nsfl1cQ9CZ44 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nsfl1cQ9CZ44 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nsfl1cQ9CZ44 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nsfl1cQ9CZ44 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nsfl1cQ9CZ44 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nsfl1cQ9CZ44 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nsfl1cQ9CZ44 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nsfl1cQ9CZ44 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nsfl1cQ9CZ44 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nsfl1cQ9CZ44 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nsfl1cQ9CZ44 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nsfl1cQ9CZ44 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nsfl1cQ9CZ44 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nsfl1cQ9CZ44 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nsfl1cQ9CZ44 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Nsfl1cQ9CZ44 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nsfl1cQ9CZ44 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nsfl1cQ9CZ44 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nsfl1cQ9CZ44 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nsfl1cQ9CZ44 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nsfl1cQ9CZ44 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nsfl1cQ9CZ44 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nsfl1cQ9CZ44 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nsfl1cQ9CZ44 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nsfl1cQ9CZ44 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nsfl1cQ9CZ44 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nsfl1cQ9CZ44 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Nsfl1cQ9CZ44 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Nsfl1cQ9CZ44 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Nsfl1cQ9CZ44 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Nsfl1cQ9CZ44 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nsfl1cQ9CZ44 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nsfl1cQ9CZ44 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nsfl1cQ9CZ44 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nsfl1cQ9CZ44 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nsfl1cQ9CZ44 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Nsfl1cQ9CZ44 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nsfl1cQ9CZ44 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nsfl1cQ9CZ44 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nsfl1cQ9CZ44 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nsfl1cQ9CZ44 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nsfl1cQ9CZ44 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nsfl1cQ9CZ44 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nsfl1cQ9CZ44 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nsfl1cQ9CZ44 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nsfl1cQ9CZ44 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nsfl1cQ9CZ44 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nsfl1cQ9CZ44 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nsfl1cQ9CZ44 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nsfl1cQ9CZ44 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nsfl1cQ9CZ44 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nsfl1cQ9CZ44 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nsfl1cQ9CZ44 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nsfl1cQ9CZ44 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nsfl1cQ9CZ44 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nsfl1cQ9CZ44 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nsfl1cQ9CZ44 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nsfl1cQ9CZ44 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nsfl1cQ9CZ44 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nsfl1cQ9CZ44 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Nsfl1cQ9CZ44 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nsfl1cQ9CZ44 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nsfl1cQ9CZ44 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nsfl1cQ9CZ44 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nsfl1cQ9CZ44 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nsfl1cQ9CZ44 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nsfl1cQ9CZ44 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nsfl1cQ9CZ44 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nsfl1cQ9CZ44 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nsfl1cQ9CZ44 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nsfl1cQ9CZ44 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nsfl1cQ9CZ44 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nsfl1cQ9CZ44 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nsfl1cQ9CZ44 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nsfl1cQ9CZ44 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nsfl1cQ9CZ44 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nsfl1cQ9CZ44 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nsfl1cQ9CZ44 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nsfl1cQ9CZ44 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nsfl1cQ9CZ44 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nsfl1cQ9CZ44 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nsfl1cQ9CZ44 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nsfl1cQ9CZ44 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nsfl1cQ9CZ44 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nsfl1cQ9CZ44 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nsfl1cQ9CZ44 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nsfl1cQ9CZ44 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nsfl1cQ9CZ44 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nsfl1cQ9CZ44 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nsfl1cQ9CZ44 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nsfl1cQ9CZ44 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nsfl1cQ9CZ44 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nsfl1cQ9CZ44 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nsfl1cQ9CZ44 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nsfl1cQ9CZ44 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nsfl1cQ9CZ44 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nsfl1cQ9CZ44 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nsfl1cQ9CZ44 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nsfl1cQ9CZ44 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.7 ms