Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYW4

Hdhd3, Haloacid dehalogenase-like hydrolase domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdhd3Q9CYW4 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hdhd3Q9CYW4 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hdhd3Q9CYW4 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hdhd3Q9CYW4 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hdhd3Q9CYW4 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hdhd3Q9CYW4 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hdhd3Q9CYW4 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hdhd3Q9CYW4 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hdhd3Q9CYW4 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hdhd3Q9CYW4 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Hdhd3Q9CYW4 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hdhd3Q9CYW4 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hdhd3Q9CYW4 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hdhd3Q9CYW4 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Hdhd3Q9CYW4 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hdhd3Q9CYW4 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hdhd3Q9CYW4 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hdhd3Q9CYW4 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hdhd3Q9CYW4 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hdhd3Q9CYW4 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hdhd3Q9CYW4 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hdhd3Q9CYW4 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hdhd3Q9CYW4 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hdhd3Q9CYW4 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hdhd3Q9CYW4 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hdhd3Q9CYW4 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hdhd3Q9CYW4 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hdhd3Q9CYW4 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hdhd3Q9CYW4 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hdhd3Q9CYW4 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hdhd3Q9CYW4 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hdhd3Q9CYW4 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hdhd3Q9CYW4 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hdhd3Q9CYW4 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hdhd3Q9CYW4 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hdhd3Q9CYW4 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hdhd3Q9CYW4 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hdhd3Q9CYW4 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hdhd3Q9CYW4 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hdhd3Q9CYW4 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hdhd3Q9CYW4 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hdhd3Q9CYW4 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hdhd3Q9CYW4 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hdhd3Q9CYW4 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hdhd3Q9CYW4 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hdhd3Q9CYW4 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hdhd3Q9CYW4 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hdhd3Q9CYW4 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hdhd3Q9CYW4 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hdhd3Q9CYW4 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hdhd3Q9CYW4 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hdhd3Q9CYW4 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hdhd3Q9CYW4 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hdhd3Q9CYW4 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hdhd3Q9CYW4 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hdhd3Q9CYW4 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hdhd3Q9CYW4 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hdhd3Q9CYW4 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hdhd3Q9CYW4 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hdhd3Q9CYW4 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hdhd3Q9CYW4 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hdhd3Q9CYW4 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hdhd3Q9CYW4 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hdhd3Q9CYW4 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hdhd3Q9CYW4 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hdhd3Q9CYW4 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hdhd3Q9CYW4 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hdhd3Q9CYW4 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hdhd3Q9CYW4 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hdhd3Q9CYW4 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hdhd3Q9CYW4 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hdhd3Q9CYW4 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hdhd3Q9CYW4 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hdhd3Q9CYW4 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hdhd3Q9CYW4 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hdhd3Q9CYW4 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hdhd3Q9CYW4 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hdhd3Q9CYW4 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hdhd3Q9CYW4 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hdhd3Q9CYW4 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hdhd3Q9CYW4 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hdhd3Q9CYW4 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hdhd3Q9CYW4 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hdhd3Q9CYW4 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hdhd3Q9CYW4 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hdhd3Q9CYW4 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hdhd3Q9CYW4 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hdhd3Q9CYW4 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hdhd3Q9CYW4 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hdhd3Q9CYW4 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hdhd3Q9CYW4 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hdhd3Q9CYW4 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hdhd3Q9CYW4 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hdhd3Q9CYW4 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hdhd3Q9CYW4 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hdhd3Q9CYW4 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hdhd3Q9CYW4 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hdhd3Q9CYW4 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hdhd3Q9CYW4 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hdhd3Q9CYW4 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms