Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYI0

Protein Njmu-R1, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CYI0 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q9CYI0 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q9CYI0 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q9CYI0 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q9CYI0 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q9CYI0 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Q9CYI0 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q9CYI0 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q9CYI0 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q9CYI0 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Q9CYI0 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q9CYI0 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q9CYI0 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q9CYI0 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q9CYI0 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Q9CYI0 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q9CYI0 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q9CYI0 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q9CYI0 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q9CYI0 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Q9CYI0 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Q9CYI0 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q9CYI0 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q9CYI0 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q9CYI0 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q9CYI0 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q9CYI0 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q9CYI0 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q9CYI0 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q9CYI0 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q9CYI0 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q9CYI0 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q9CYI0 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q9CYI0 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q9CYI0 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q9CYI0 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q9CYI0 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q9CYI0 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q9CYI0 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q9CYI0 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q9CYI0 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q9CYI0 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q9CYI0 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q9CYI0 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Q9CYI0 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q9CYI0 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q9CYI0 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q9CYI0 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q9CYI0 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q9CYI0 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q9CYI0 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q9CYI0 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q9CYI0 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q9CYI0 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q9CYI0 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q9CYI0 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q9CYI0 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q9CYI0 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q9CYI0 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q9CYI0 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Q9CYI0 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q9CYI0 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q9CYI0 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q9CYI0 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q9CYI0 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q9CYI0 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q9CYI0 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q9CYI0 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Q9CYI0 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q9CYI0 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q9CYI0 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q9CYI0 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q9CYI0 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q9CYI0 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q9CYI0 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q9CYI0 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q9CYI0 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q9CYI0 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q9CYI0 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q9CYI0 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q9CYI0 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q9CYI0 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q9CYI0 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q9CYI0 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q9CYI0 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q9CYI0 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q9CYI0 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Q9CYI0 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q9CYI0 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q9CYI0 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q9CYI0 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q9CYI0 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q9CYI0 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q9CYI0 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Q9CYI0 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Q9CYI0 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Q9CYI0 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q9CYI0 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q9CYI0 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q9CYI0 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms