Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYB0

Trim13, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM13, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim13Q9CYB0 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim13Q9CYB0 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim13Q9CYB0 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim13Q9CYB0 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim13Q9CYB0 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim13Q9CYB0 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim13Q9CYB0 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim13Q9CYB0 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim13Q9CYB0 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim13Q9CYB0 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim13Q9CYB0 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim13Q9CYB0 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim13Q9CYB0 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim13Q9CYB0 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim13Q9CYB0 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim13Q9CYB0 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim13Q9CYB0 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim13Q9CYB0 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim13Q9CYB0 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim13Q9CYB0 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim13Q9CYB0 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim13Q9CYB0 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim13Q9CYB0 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim13Q9CYB0 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim13Q9CYB0 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim13Q9CYB0 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim13Q9CYB0 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim13Q9CYB0 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim13Q9CYB0 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim13Q9CYB0 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim13Q9CYB0 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim13Q9CYB0 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim13Q9CYB0 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim13Q9CYB0 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim13Q9CYB0 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim13Q9CYB0 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim13Q9CYB0 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim13Q9CYB0 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim13Q9CYB0 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim13Q9CYB0 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim13Q9CYB0 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim13Q9CYB0 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim13Q9CYB0 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim13Q9CYB0 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim13Q9CYB0 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim13Q9CYB0 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim13Q9CYB0 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim13Q9CYB0 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim13Q9CYB0 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim13Q9CYB0 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim13Q9CYB0 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim13Q9CYB0 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim13Q9CYB0 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim13Q9CYB0 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim13Q9CYB0 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim13Q9CYB0 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim13Q9CYB0 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim13Q9CYB0 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim13Q9CYB0 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim13Q9CYB0 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim13Q9CYB0 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim13Q9CYB0 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim13Q9CYB0 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim13Q9CYB0 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim13Q9CYB0 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim13Q9CYB0 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim13Q9CYB0 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim13Q9CYB0 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim13Q9CYB0 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim13Q9CYB0 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim13Q9CYB0 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim13Q9CYB0 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim13Q9CYB0 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim13Q9CYB0 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim13Q9CYB0 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim13Q9CYB0 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim13Q9CYB0 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim13Q9CYB0 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim13Q9CYB0 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim13Q9CYB0 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim13Q9CYB0 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim13Q9CYB0 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim13Q9CYB0 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim13Q9CYB0 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim13Q9CYB0 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim13Q9CYB0 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim13Q9CYB0 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim13Q9CYB0 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim13Q9CYB0 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim13Q9CYB0 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim13Q9CYB0 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim13Q9CYB0 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim13Q9CYB0 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim13Q9CYB0 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim13Q9CYB0 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim13Q9CYB0 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim13Q9CYB0 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trim13Q9CYB0 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trim13Q9CYB0 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim13Q9CYB0 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms