Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY97

Ssu72, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase SSU72, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssu72Q9CY97 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ssu72Q9CY97 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ssu72Q9CY97 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ssu72Q9CY97 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ssu72Q9CY97 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ssu72Q9CY97 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ssu72Q9CY97 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ssu72Q9CY97 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Ssu72Q9CY97 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ssu72Q9CY97 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ssu72Q9CY97 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ssu72Q9CY97 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ssu72Q9CY97 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ssu72Q9CY97 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ssu72Q9CY97 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ssu72Q9CY97 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ssu72Q9CY97 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ssu72Q9CY97 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ssu72Q9CY97 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ssu72Q9CY97 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ssu72Q9CY97 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ssu72Q9CY97 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ssu72Q9CY97 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ssu72Q9CY97 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ssu72Q9CY97 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ssu72Q9CY97 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ssu72Q9CY97 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ssu72Q9CY97 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ssu72Q9CY97 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ssu72Q9CY97 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ssu72Q9CY97 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ssu72Q9CY97 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ssu72Q9CY97 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ssu72Q9CY97 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ssu72Q9CY97 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ssu72Q9CY97 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ssu72Q9CY97 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ssu72Q9CY97 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ssu72Q9CY97 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ssu72Q9CY97 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ssu72Q9CY97 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ssu72Q9CY97 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ssu72Q9CY97 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ssu72Q9CY97 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ssu72Q9CY97 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ssu72Q9CY97 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ssu72Q9CY97 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ssu72Q9CY97 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ssu72Q9CY97 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ssu72Q9CY97 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ssu72Q9CY97 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ssu72Q9CY97 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ssu72Q9CY97 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ssu72Q9CY97 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ssu72Q9CY97 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Ssu72Q9CY97 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ssu72Q9CY97 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ssu72Q9CY97 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ssu72Q9CY97 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ssu72Q9CY97 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ssu72Q9CY97 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ssu72Q9CY97 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Ssu72Q9CY97 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ssu72Q9CY97 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ssu72Q9CY97 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ssu72Q9CY97 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ssu72Q9CY97 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Ssu72Q9CY97 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ssu72Q9CY97 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ssu72Q9CY97 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ssu72Q9CY97 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ssu72Q9CY97 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ssu72Q9CY97 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ssu72Q9CY97 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Ssu72Q9CY97 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ssu72Q9CY97 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ssu72Q9CY97 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ssu72Q9CY97 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ssu72Q9CY97 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ssu72Q9CY97 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ssu72Q9CY97 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ssu72Q9CY97 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ssu72Q9CY97 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ssu72Q9CY97 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ssu72Q9CY97 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ssu72Q9CY97 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ssu72Q9CY97 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ssu72Q9CY97 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Ssu72Q9CY97 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ssu72Q9CY97 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ssu72Q9CY97 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ssu72Q9CY97 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ssu72Q9CY97 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ssu72Q9CY97 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ssu72Q9CY97 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ssu72Q9CY97 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ssu72Q9CY97 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ssu72Q9CY97 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ssu72Q9CY97 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ssu72Q9CY97 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms