Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY94

Gins3, DNA replication complex GINS protein PSF3, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gins3Q9CY94 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Gins3Q9CY94 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gins3Q9CY94 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gins3Q9CY94 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gins3Q9CY94 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gins3Q9CY94 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gins3Q9CY94 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gins3Q9CY94 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Gins3Q9CY94 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gins3Q9CY94 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gins3Q9CY94 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gins3Q9CY94 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gins3Q9CY94 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Gins3Q9CY94 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Gins3Q9CY94 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gins3Q9CY94 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Gins3Q9CY94 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gins3Q9CY94 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gins3Q9CY94 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gins3Q9CY94 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gins3Q9CY94 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gins3Q9CY94 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gins3Q9CY94 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gins3Q9CY94 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gins3Q9CY94 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gins3Q9CY94 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gins3Q9CY94 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gins3Q9CY94 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gins3Q9CY94 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gins3Q9CY94 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gins3Q9CY94 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gins3Q9CY94 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gins3Q9CY94 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Gins3Q9CY94 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gins3Q9CY94 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gins3Q9CY94 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gins3Q9CY94 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gins3Q9CY94 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gins3Q9CY94 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gins3Q9CY94 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gins3Q9CY94 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gins3Q9CY94 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gins3Q9CY94 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gins3Q9CY94 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gins3Q9CY94 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gins3Q9CY94 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gins3Q9CY94 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gins3Q9CY94 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Gins3Q9CY94 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gins3Q9CY94 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gins3Q9CY94 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gins3Q9CY94 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gins3Q9CY94 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gins3Q9CY94 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Gins3Q9CY94 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Gins3Q9CY94 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Gins3Q9CY94 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Gins3Q9CY94 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gins3Q9CY94 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gins3Q9CY94 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gins3Q9CY94 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gins3Q9CY94 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gins3Q9CY94 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gins3Q9CY94 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gins3Q9CY94 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gins3Q9CY94 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gins3Q9CY94 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gins3Q9CY94 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gins3Q9CY94 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gins3Q9CY94 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gins3Q9CY94 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gins3Q9CY94 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gins3Q9CY94 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gins3Q9CY94 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gins3Q9CY94 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gins3Q9CY94 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gins3Q9CY94 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gins3Q9CY94 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gins3Q9CY94 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Gins3Q9CY94 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gins3Q9CY94 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gins3Q9CY94 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gins3Q9CY94 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gins3Q9CY94 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gins3Q9CY94 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gins3Q9CY94 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gins3Q9CY94 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Gins3Q9CY94 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gins3Q9CY94 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gins3Q9CY94 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gins3Q9CY94 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gins3Q9CY94 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gins3Q9CY94 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gins3Q9CY94 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gins3Q9CY94 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gins3Q9CY94 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gins3Q9CY94 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gins3Q9CY94 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gins3Q9CY94 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Gins3Q9CY94 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms