Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE7

Tmed5, Transmembrane emp24 domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed5Q9CXE7 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmed5Q9CXE7 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmed5Q9CXE7 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmed5Q9CXE7 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmed5Q9CXE7 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmed5Q9CXE7 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmed5Q9CXE7 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmed5Q9CXE7 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmed5Q9CXE7 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmed5Q9CXE7 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmed5Q9CXE7 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmed5Q9CXE7 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmed5Q9CXE7 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmed5Q9CXE7 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmed5Q9CXE7 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmed5Q9CXE7 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmed5Q9CXE7 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmed5Q9CXE7 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmed5Q9CXE7 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmed5Q9CXE7 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmed5Q9CXE7 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmed5Q9CXE7 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmed5Q9CXE7 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmed5Q9CXE7 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmed5Q9CXE7 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmed5Q9CXE7 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmed5Q9CXE7 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmed5Q9CXE7 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmed5Q9CXE7 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmed5Q9CXE7 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmed5Q9CXE7 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmed5Q9CXE7 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmed5Q9CXE7 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmed5Q9CXE7 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmed5Q9CXE7 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmed5Q9CXE7 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmed5Q9CXE7 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmed5Q9CXE7 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmed5Q9CXE7 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmed5Q9CXE7 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmed5Q9CXE7 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmed5Q9CXE7 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmed5Q9CXE7 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmed5Q9CXE7 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmed5Q9CXE7 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmed5Q9CXE7 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmed5Q9CXE7 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmed5Q9CXE7 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmed5Q9CXE7 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmed5Q9CXE7 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmed5Q9CXE7 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmed5Q9CXE7 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmed5Q9CXE7 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmed5Q9CXE7 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmed5Q9CXE7 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmed5Q9CXE7 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmed5Q9CXE7 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmed5Q9CXE7 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmed5Q9CXE7 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmed5Q9CXE7 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmed5Q9CXE7 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmed5Q9CXE7 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmed5Q9CXE7 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmed5Q9CXE7 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmed5Q9CXE7 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmed5Q9CXE7 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmed5Q9CXE7 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmed5Q9CXE7 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmed5Q9CXE7 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmed5Q9CXE7 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmed5Q9CXE7 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmed5Q9CXE7 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmed5Q9CXE7 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmed5Q9CXE7 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmed5Q9CXE7 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmed5Q9CXE7 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmed5Q9CXE7 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmed5Q9CXE7 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmed5Q9CXE7 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmed5Q9CXE7 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmed5Q9CXE7 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmed5Q9CXE7 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmed5Q9CXE7 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmed5Q9CXE7 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmed5Q9CXE7 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmed5Q9CXE7 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmed5Q9CXE7 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmed5Q9CXE7 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmed5Q9CXE7 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmed5Q9CXE7 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmed5Q9CXE7 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmed5Q9CXE7 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmed5Q9CXE7 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmed5Q9CXE7 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmed5Q9CXE7 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmed5Q9CXE7 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmed5Q9CXE7 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmed5Q9CXE7 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmed5Q9CXE7 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmed5Q9CXE7 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms