Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWM4

Pfdn1, Prefoldin subunit 1, mousemouse

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Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn1Q9CWM4 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pfdn1Q9CWM4 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pfdn1Q9CWM4 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pfdn1Q9CWM4 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pfdn1Q9CWM4 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Pfdn1Q9CWM4 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pfdn1Q9CWM4 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Pfdn1Q9CWM4 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pfdn1Q9CWM4 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pfdn1Q9CWM4 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pfdn1Q9CWM4 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pfdn1Q9CWM4 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pfdn1Q9CWM4 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pfdn1Q9CWM4 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pfdn1Q9CWM4 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Pfdn1Q9CWM4 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pfdn1Q9CWM4 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pfdn1Q9CWM4 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Pfdn1Q9CWM4 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pfdn1Q9CWM4 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pfdn1Q9CWM4 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pfdn1Q9CWM4 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pfdn1Q9CWM4 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pfdn1Q9CWM4 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pfdn1Q9CWM4 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Pfdn1Q9CWM4 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pfdn1Q9CWM4 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pfdn1Q9CWM4 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pfdn1Q9CWM4 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pfdn1Q9CWM4 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pfdn1Q9CWM4 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pfdn1Q9CWM4 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pfdn1Q9CWM4 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pfdn1Q9CWM4 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pfdn1Q9CWM4 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pfdn1Q9CWM4 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pfdn1Q9CWM4 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pfdn1Q9CWM4 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pfdn1Q9CWM4 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pfdn1Q9CWM4 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pfdn1Q9CWM4 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pfdn1Q9CWM4 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pfdn1Q9CWM4 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pfdn1Q9CWM4 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pfdn1Q9CWM4 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pfdn1Q9CWM4 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pfdn1Q9CWM4 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pfdn1Q9CWM4 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pfdn1Q9CWM4 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pfdn1Q9CWM4 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pfdn1Q9CWM4 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Pfdn1Q9CWM4 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pfdn1Q9CWM4 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pfdn1Q9CWM4 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pfdn1Q9CWM4 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pfdn1Q9CWM4 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pfdn1Q9CWM4 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pfdn1Q9CWM4 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pfdn1Q9CWM4 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pfdn1Q9CWM4 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pfdn1Q9CWM4 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pfdn1Q9CWM4 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pfdn1Q9CWM4 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pfdn1Q9CWM4 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Pfdn1Q9CWM4 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pfdn1Q9CWM4 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pfdn1Q9CWM4 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pfdn1Q9CWM4 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pfdn1Q9CWM4 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pfdn1Q9CWM4 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pfdn1Q9CWM4 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pfdn1Q9CWM4 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pfdn1Q9CWM4 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pfdn1Q9CWM4 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pfdn1Q9CWM4 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pfdn1Q9CWM4 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pfdn1Q9CWM4 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pfdn1Q9CWM4 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pfdn1Q9CWM4 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pfdn1Q9CWM4 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pfdn1Q9CWM4 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pfdn1Q9CWM4 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pfdn1Q9CWM4 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pfdn1Q9CWM4 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pfdn1Q9CWM4 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pfdn1Q9CWM4 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Pfdn1Q9CWM4 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pfdn1Q9CWM4 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Pfdn1Q9CWM4 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pfdn1Q9CWM4 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pfdn1Q9CWM4 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pfdn1Q9CWM4 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pfdn1Q9CWM4 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pfdn1Q9CWM4 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pfdn1Q9CWM4 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pfdn1Q9CWM4 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pfdn1Q9CWM4 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pfdn1Q9CWM4 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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