Protein–RNA interactions for Protein: Q9CT10

Ranbp3, Ran-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ranbp3Q9CT10 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ranbp3Q9CT10 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ranbp3Q9CT10 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Ranbp3Q9CT10 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ranbp3Q9CT10 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ranbp3Q9CT10 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ranbp3Q9CT10 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Ranbp3Q9CT10 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Ranbp3Q9CT10 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ranbp3Q9CT10 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ranbp3Q9CT10 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Ranbp3Q9CT10 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ranbp3Q9CT10 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ranbp3Q9CT10 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ranbp3Q9CT10 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ranbp3Q9CT10 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ranbp3Q9CT10 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ranbp3Q9CT10 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Ranbp3Q9CT10 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ranbp3Q9CT10 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ranbp3Q9CT10 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ranbp3Q9CT10 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Ranbp3Q9CT10 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ranbp3Q9CT10 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ranbp3Q9CT10 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ranbp3Q9CT10 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Ranbp3Q9CT10 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ranbp3Q9CT10 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ranbp3Q9CT10 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ranbp3Q9CT10 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Ranbp3Q9CT10 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ranbp3Q9CT10 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ranbp3Q9CT10 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ranbp3Q9CT10 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ranbp3Q9CT10 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ranbp3Q9CT10 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ranbp3Q9CT10 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ranbp3Q9CT10 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ranbp3Q9CT10 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ranbp3Q9CT10 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ranbp3Q9CT10 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ranbp3Q9CT10 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ranbp3Q9CT10 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ranbp3Q9CT10 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ranbp3Q9CT10 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ranbp3Q9CT10 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ranbp3Q9CT10 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ranbp3Q9CT10 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ranbp3Q9CT10 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ranbp3Q9CT10 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Ranbp3Q9CT10 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ranbp3Q9CT10 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ranbp3Q9CT10 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ranbp3Q9CT10 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ranbp3Q9CT10 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ranbp3Q9CT10 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms