Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rprd1bQ9CSU0 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rprd1bQ9CSU0 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rprd1bQ9CSU0 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rprd1bQ9CSU0 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rprd1bQ9CSU0 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rprd1bQ9CSU0 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rprd1bQ9CSU0 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rprd1bQ9CSU0 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rprd1bQ9CSU0 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rprd1bQ9CSU0 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rprd1bQ9CSU0 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rprd1bQ9CSU0 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rprd1bQ9CSU0 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rprd1bQ9CSU0 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rprd1bQ9CSU0 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rprd1bQ9CSU0 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rprd1bQ9CSU0 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rprd1bQ9CSU0 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rprd1bQ9CSU0 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rprd1bQ9CSU0 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rprd1bQ9CSU0 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rprd1bQ9CSU0 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rprd1bQ9CSU0 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rprd1bQ9CSU0 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rprd1bQ9CSU0 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rprd1bQ9CSU0 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rprd1bQ9CSU0 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rprd1bQ9CSU0 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rprd1bQ9CSU0 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rprd1bQ9CSU0 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rprd1bQ9CSU0 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rprd1bQ9CSU0 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rprd1bQ9CSU0 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rprd1bQ9CSU0 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rprd1bQ9CSU0 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rprd1bQ9CSU0 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rprd1bQ9CSU0 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rprd1bQ9CSU0 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rprd1bQ9CSU0 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rprd1bQ9CSU0 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rprd1bQ9CSU0 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rprd1bQ9CSU0 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rprd1bQ9CSU0 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rprd1bQ9CSU0 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rprd1bQ9CSU0 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rprd1bQ9CSU0 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rprd1bQ9CSU0 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rprd1bQ9CSU0 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rprd1bQ9CSU0 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rprd1bQ9CSU0 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rprd1bQ9CSU0 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rprd1bQ9CSU0 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rprd1bQ9CSU0 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rprd1bQ9CSU0 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rprd1bQ9CSU0 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rprd1bQ9CSU0 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rprd1bQ9CSU0 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rprd1bQ9CSU0 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rprd1bQ9CSU0 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rprd1bQ9CSU0 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rprd1bQ9CSU0 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rprd1bQ9CSU0 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rprd1bQ9CSU0 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rprd1bQ9CSU0 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rprd1bQ9CSU0 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rprd1bQ9CSU0 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rprd1bQ9CSU0 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rprd1bQ9CSU0 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rprd1bQ9CSU0 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rprd1bQ9CSU0 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rprd1bQ9CSU0 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rprd1bQ9CSU0 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rprd1bQ9CSU0 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rprd1bQ9CSU0 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rprd1bQ9CSU0 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rprd1bQ9CSU0 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rprd1bQ9CSU0 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rprd1bQ9CSU0 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rprd1bQ9CSU0 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rprd1bQ9CSU0 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rprd1bQ9CSU0 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rprd1bQ9CSU0 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rprd1bQ9CSU0 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rprd1bQ9CSU0 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rprd1bQ9CSU0 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rprd1bQ9CSU0 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rprd1bQ9CSU0 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rprd1bQ9CSU0 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rprd1bQ9CSU0 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rprd1bQ9CSU0 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rprd1bQ9CSU0 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rprd1bQ9CSU0 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rprd1bQ9CSU0 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rprd1bQ9CSU0 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rprd1bQ9CSU0 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rprd1bQ9CSU0 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rprd1bQ9CSU0 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rprd1bQ9CSU0 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rprd1bQ9CSU0 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms