Protein–RNA interactions for Protein: Q9CS72

Filip1, Filamin-A-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Filip1Q9CS72 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Filip1Q9CS72 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Filip1Q9CS72 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Filip1Q9CS72 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Filip1Q9CS72 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Filip1Q9CS72 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Filip1Q9CS72 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Filip1Q9CS72 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Filip1Q9CS72 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Filip1Q9CS72 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Filip1Q9CS72 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Filip1Q9CS72 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Filip1Q9CS72 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Filip1Q9CS72 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Filip1Q9CS72 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Filip1Q9CS72 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Filip1Q9CS72 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Filip1Q9CS72 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Filip1Q9CS72 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Filip1Q9CS72 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Filip1Q9CS72 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Filip1Q9CS72 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Filip1Q9CS72 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Filip1Q9CS72 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Filip1Q9CS72 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Filip1Q9CS72 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Filip1Q9CS72 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Filip1Q9CS72 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Filip1Q9CS72 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Filip1Q9CS72 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Filip1Q9CS72 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Filip1Q9CS72 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Filip1Q9CS72 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Filip1Q9CS72 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Filip1Q9CS72 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Filip1Q9CS72 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Filip1Q9CS72 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Filip1Q9CS72 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Filip1Q9CS72 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Filip1Q9CS72 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Filip1Q9CS72 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Filip1Q9CS72 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Filip1Q9CS72 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Filip1Q9CS72 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Filip1Q9CS72 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Filip1Q9CS72 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Filip1Q9CS72 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Filip1Q9CS72 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Filip1Q9CS72 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Filip1Q9CS72 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Filip1Q9CS72 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Filip1Q9CS72 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Filip1Q9CS72 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Filip1Q9CS72 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Filip1Q9CS72 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Filip1Q9CS72 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Filip1Q9CS72 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Filip1Q9CS72 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Filip1Q9CS72 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Filip1Q9CS72 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Filip1Q9CS72 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Filip1Q9CS72 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Filip1Q9CS72 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Filip1Q9CS72 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Filip1Q9CS72 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Filip1Q9CS72 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Filip1Q9CS72 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Filip1Q9CS72 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Filip1Q9CS72 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Filip1Q9CS72 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Filip1Q9CS72 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Filip1Q9CS72 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Filip1Q9CS72 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Filip1Q9CS72 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Filip1Q9CS72 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Filip1Q9CS72 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Filip1Q9CS72 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Filip1Q9CS72 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Filip1Q9CS72 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Filip1Q9CS72 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Filip1Q9CS72 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Filip1Q9CS72 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Filip1Q9CS72 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Filip1Q9CS72 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Filip1Q9CS72 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Filip1Q9CS72 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Filip1Q9CS72 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Filip1Q9CS72 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Filip1Q9CS72 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Filip1Q9CS72 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Filip1Q9CS72 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Filip1Q9CS72 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Filip1Q9CS72 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Filip1Q9CS72 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Filip1Q9CS72 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Filip1Q9CS72 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Filip1Q9CS72 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Filip1Q9CS72 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Filip1Q9CS72 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Filip1Q9CS72 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms