Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR41

Hypk, Huntingtin-interacting protein K, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HypkQ9CR41 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HypkQ9CR41 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HypkQ9CR41 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HypkQ9CR41 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HypkQ9CR41 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HypkQ9CR41 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HypkQ9CR41 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HypkQ9CR41 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HypkQ9CR41 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HypkQ9CR41 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HypkQ9CR41 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HypkQ9CR41 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
HypkQ9CR41 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HypkQ9CR41 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HypkQ9CR41 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HypkQ9CR41 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HypkQ9CR41 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
HypkQ9CR41 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HypkQ9CR41 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HypkQ9CR41 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HypkQ9CR41 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
HypkQ9CR41 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
HypkQ9CR41 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HypkQ9CR41 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HypkQ9CR41 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HypkQ9CR41 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HypkQ9CR41 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HypkQ9CR41 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
HypkQ9CR41 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HypkQ9CR41 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HypkQ9CR41 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HypkQ9CR41 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HypkQ9CR41 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HypkQ9CR41 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HypkQ9CR41 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HypkQ9CR41 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
HypkQ9CR41 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
HypkQ9CR41 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
HypkQ9CR41 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HypkQ9CR41 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HypkQ9CR41 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HypkQ9CR41 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HypkQ9CR41 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HypkQ9CR41 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HypkQ9CR41 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
HypkQ9CR41 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HypkQ9CR41 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HypkQ9CR41 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HypkQ9CR41 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HypkQ9CR41 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HypkQ9CR41 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HypkQ9CR41 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
HypkQ9CR41 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
HypkQ9CR41 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HypkQ9CR41 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HypkQ9CR41 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HypkQ9CR41 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HypkQ9CR41 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HypkQ9CR41 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HypkQ9CR41 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HypkQ9CR41 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HypkQ9CR41 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HypkQ9CR41 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HypkQ9CR41 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HypkQ9CR41 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HypkQ9CR41 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HypkQ9CR41 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HypkQ9CR41 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HypkQ9CR41 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HypkQ9CR41 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HypkQ9CR41 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HypkQ9CR41 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HypkQ9CR41 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HypkQ9CR41 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HypkQ9CR41 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HypkQ9CR41 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HypkQ9CR41 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HypkQ9CR41 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HypkQ9CR41 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HypkQ9CR41 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HypkQ9CR41 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HypkQ9CR41 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HypkQ9CR41 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HypkQ9CR41 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HypkQ9CR41 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HypkQ9CR41 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HypkQ9CR41 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HypkQ9CR41 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HypkQ9CR41 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HypkQ9CR41 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HypkQ9CR41 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HypkQ9CR41 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HypkQ9CR41 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HypkQ9CR41 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HypkQ9CR41 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HypkQ9CR41 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HypkQ9CR41 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HypkQ9CR41 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HypkQ9CR41 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HypkQ9CR41 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms