Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQK7

Rwdd1, RWD domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rwdd1Q9CQK7 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rwdd1Q9CQK7 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rwdd1Q9CQK7 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rwdd1Q9CQK7 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rwdd1Q9CQK7 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rwdd1Q9CQK7 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rwdd1Q9CQK7 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Rwdd1Q9CQK7 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rwdd1Q9CQK7 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rwdd1Q9CQK7 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rwdd1Q9CQK7 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rwdd1Q9CQK7 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rwdd1Q9CQK7 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rwdd1Q9CQK7 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rwdd1Q9CQK7 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rwdd1Q9CQK7 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rwdd1Q9CQK7 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rwdd1Q9CQK7 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rwdd1Q9CQK7 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rwdd1Q9CQK7 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Rwdd1Q9CQK7 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rwdd1Q9CQK7 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rwdd1Q9CQK7 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rwdd1Q9CQK7 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rwdd1Q9CQK7 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rwdd1Q9CQK7 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rwdd1Q9CQK7 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rwdd1Q9CQK7 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rwdd1Q9CQK7 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rwdd1Q9CQK7 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rwdd1Q9CQK7 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rwdd1Q9CQK7 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rwdd1Q9CQK7 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rwdd1Q9CQK7 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rwdd1Q9CQK7 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Rwdd1Q9CQK7 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rwdd1Q9CQK7 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rwdd1Q9CQK7 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rwdd1Q9CQK7 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rwdd1Q9CQK7 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rwdd1Q9CQK7 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rwdd1Q9CQK7 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rwdd1Q9CQK7 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rwdd1Q9CQK7 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Rwdd1Q9CQK7 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Rwdd1Q9CQK7 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rwdd1Q9CQK7 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rwdd1Q9CQK7 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rwdd1Q9CQK7 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rwdd1Q9CQK7 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rwdd1Q9CQK7 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rwdd1Q9CQK7 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rwdd1Q9CQK7 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rwdd1Q9CQK7 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Rwdd1Q9CQK7 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rwdd1Q9CQK7 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rwdd1Q9CQK7 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rwdd1Q9CQK7 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rwdd1Q9CQK7 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rwdd1Q9CQK7 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rwdd1Q9CQK7 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rwdd1Q9CQK7 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rwdd1Q9CQK7 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rwdd1Q9CQK7 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rwdd1Q9CQK7 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rwdd1Q9CQK7 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rwdd1Q9CQK7 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rwdd1Q9CQK7 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rwdd1Q9CQK7 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rwdd1Q9CQK7 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rwdd1Q9CQK7 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rwdd1Q9CQK7 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rwdd1Q9CQK7 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rwdd1Q9CQK7 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rwdd1Q9CQK7 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rwdd1Q9CQK7 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rwdd1Q9CQK7 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Rwdd1Q9CQK7 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Rwdd1Q9CQK7 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rwdd1Q9CQK7 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rwdd1Q9CQK7 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rwdd1Q9CQK7 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rwdd1Q9CQK7 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rwdd1Q9CQK7 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rwdd1Q9CQK7 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rwdd1Q9CQK7 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rwdd1Q9CQK7 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rwdd1Q9CQK7 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rwdd1Q9CQK7 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rwdd1Q9CQK7 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rwdd1Q9CQK7 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rwdd1Q9CQK7 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rwdd1Q9CQK7 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rwdd1Q9CQK7 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rwdd1Q9CQK7 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Rwdd1Q9CQK7 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rwdd1Q9CQK7 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rwdd1Q9CQK7 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rwdd1Q9CQK7 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rwdd1Q9CQK7 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.7 ms